הממונה על הביטחון במשרד הביטחון (המלמ"ב) דורש מסניגוריהם של הנאשמים בפרשת הצוללות לא רק סיווג אישי, אלא גם אמצעי ביטחון מוגברים במשרדיהם הכוללים עבודות בנייה ותוספת סורגים. כך מסרו (יום א', 3.10.21) כמה מן הסניגורים לבית המשפט המחוזי בתל אביב. חלקם גם מתלוננים על השחרות ניכרות ובלתי סבירות בחומרי החקירה.
עו"ד איתן מעוז, סניגורו של מיקי גנור, אמר לסגן נשיא בית המשפט המחוזי בתל אביב, בני שגיא: "בשל המיקום של המשרד בקומה נמוכה, נציגי משרד הביטחון העלו דרישות יוצאות דופן. רוצים לבצר את משרדי, כמו למשל לשבור קירות ולשים סורגים. קבעתי פגישה נוספת עם אנשים אלה על-מנת לבחון אפשרות למתן מעט את דרישותיהם. אנחנו חייבים לקבל את החומרים אלינו. גם ההצעה לפצל את החומרים למסווגים וללא-מסווגים איננה יעילה".
עו"ד ז'ק חן, סניגורו של אבריאל בר-יוסף, טען בנוגע לחומרי החקירה: "מרבית החומר מסווג והקטעים המסווגים בו מושחרים. מרבית החומר בתיק אינו [צריך להיות] מסווג בכלל, וזה מגיע לרמות שחומר שנמצא מסווג - מדברים עליו אנשים שהגישו תצהירים לבג"ץ, בראיונות טלוויזיה ובתצהירים ל[תמיכה בעתירת התנועה] לאיכות השלטון... יש כאן היפוך יוצרות מוחלט, כמו איסור פרסום באופן גורף, ללא הנמקה או הפניה למקור חוקי, וללא חוות דעת המגיעה בפני בית המשפט שצריך להחליט בסוגיה זו, מה הסוד והקשר הקונקרטי בין חומרי החקירה שמבקשים לחסות".
עו"ד אירית באומהורן, המייצגת את שי ברוש, הסכימה עם חן והוסיפה: "זה לא משהו של שבוע-שבועיים אלא הרבה יותר ארוך. איפה שכתוב את המילה 'צוללות' או 'מצרים', זה הוגדר כסודי. לטעמי, זה לא נכנס בהערכה זו".
התובע עו"ד אלעד פנחס השיב, שהסיווג אינו נעשה בידי הפרקליטות אלא בידי המלמ"ב. לדבריו, כמות החומר המושחר היא קטנה ויש בתיק כמויות גדולות של חומר שלא הושחר, כדי שההגנה תוכל לבצע את מלאכתה. לדברי פנחס, הפרקליטות אינה מבקשת לנהל את המשפט במחשכים, אלא לקבוע נהלים לכך שהדיונים יתנהלו בדלתיים סגורות ושהפרוטוקולים שלהם יפורסמו בסמוך אליהם, לאחר שיימחקו מהם פרטים מסווגים - בעיקר פרטים צבאיים. "חלק ניכר מן העדים יוכל להעיד מלכתחילה בדלתיים פתוחות", הודיע. עוד אמר כי חוות הדעת עליה מתבססת הפרקליטות תוגש בהמשך - אך לעיונו של שגיא בלבד.
החלטתו של שגיא מלמדת, כי יעברו עוד חודשים רבים עד לפתיחת הליך ההוכחות. הוא אומר כי הליך הסיווג - ההכרחי להעברת חומרי החקירה - טרם הושלם לגבי חלק מן הסניגורים. לפיכך, הוא קבע דיון נוסף ב-26.12.21 כדי לעמוד על השלמת הליכי הסיווג והעברת חומרי החקירה, ורק לאחר מכן ניתן יהיה לדון בבקשת המדינה לקיים את המשפט בדלתיים סגורות ובקביעת הדיון לגבי פרסום הפרוטוקולים.