שירות בתי הסוהר מקיים מסלולי כליאה ושיקום נפרדים למאות אסירים דתיים. בחמישה בתי כלא מתקיימים אגפים נפרדים לאסירים דתיים, שהאחרון בהם - האגף התורני בכלא איילון ובו 80 מקומות כליאה - הוקם עם מינויו של הרב עופר אלמליח לרב הראשי לשב"ס לפני כשנתיים. סך הכל יש בשב"ס 387 מקומות כליאה לדתיים בלבד - בכלא צלמון בצפון הארץ, במעשיהו, איילון ורימונים במרכז הארץ ובדקל בדרום.
מקור בשב"ס אמר ל-News1 כי שלטונות שירות בתי הסוהר דחו תביעה מצד אסירים דתיים למנוע כניסת עובדות סוציאליות לאגף הדתי. לאחר מו"מ הוסכם שהעובדות תיכנסנה לאגפים הדתיים בלווית רב בית הכלא.
תנאי הכליאה באגפים הדתיים נחשבים לטובים יותר: החדרים מרווחים, האסירים זכאים לאוכל מיוחד - כשר למהדרין, והם מקבלים שיעורי תורה. האסירים מתקבלים לאגפים הדתיים רק לאחר אבחון קפדני הנעשה על-ידי רב, שמטרתו לבדוק האם לאסיר יש נטייה לאמונה הדתית ולמסורת ישראל.
האסירים הדתיים זכאים לשיקום תורני. לאחרונה מונה הרב גבריאל עזרא לתפקיד ראש ענף תקון תורני בשב"ס. הרבנות הראשית של שירות בתי הסוהר מפעילה הכשרה מקצועית לאסירים הנמצאים באגפים התורניים במטרה להעניק להם כלים לפרנסה בכבוד במסגרת הקהילתית במקצועות ישימים בקהילה הדתית כגון קורס משגיחי כשרות. בשב"ס אומרים כי אסירים שעברו שיקום תורני, שבים לכלא פחות מהאחרים.
מדרשות תורניות
על-פי הדוח השנתי של השב"ס, 2,670 כלואים, שהם 30 אחוזים מכלל האסירים בישראל, לומדים תורה בבתי מדרש שמפעילה רבנות שב"ס.
המדרשות התורניות של שב"ס מופעלות על-ידי זכיין שנבחר במכרז. הן פועלות ככיתות לימוד ונמצאות בפיקוח ובהנחיה של הרבנות הראשית לשב"ס. המדרשות מחולקות לשלוש רמות לימוד בהתאמה לרמת הלומדים: מתחילים, מתקדמים, תורני. נושאי הלימוד: לימוד חומש על-פי פרשת השבוע, הלכה, אמונה, חסידות, עבודת המידות.
המדרשות משתלבות במערך העסקת אסירים בבתי הסוהר ונחשבות כ"חליפות תיקון" במסגרת הטיפול המשולב באסירים. בשנת 2018 הפעילה רבנות השב"ס 80 מדרשות תורניות שמתוכן 5 מדרשות הופעלו באמצעות אסירים עוזרי הוראה בתמיכת רב היחידה.
- תגובת דוברות שירות בתי הסוהר: "בשירות בתי הסוהר אין מסלולי כליאה תורניים, אלא קיימות מסגרות תורניות הפועלות מזה שנים רבות ומשולבות במסלול הכליאה האחיד של כל האסירים. ישנם בסך-הכל חמישה אגפים תורניים הפרושים בשלושת מחוזות שב"ס. ההבדל היחיד בתנאי הכליאה באגפים התורניים הוא אורח החיים הדתי הנוהג בהם. ועדת המיון הארצית ממיינת אסירים אלו ככל האסירים בשב"ס בנוסף לאבחון רב הדרוש בטרם ישובץ אסיר לאגף תורני. הקריטריונים לשיבוץ הינם בהתאם לרמת הביטחון של בית הסוהר ולכללים הנדרשים לשהייה באגף תורני. האסירים המשולבים באגפים התורניים נוטלים חלק בלימודים תורניים, חלקם משולבים גם בתעסוקה או במסגרת הכשרה מקצועית וכן בלימודים להשכלת יסוד. בנוסף, קיימות מדרשיות הפועלות בכלל האגפים בבתי הסוהר שלומדים בהם בממוצע כ-900 אסירים. המדרשיות מופעלות ע"י זכיין שנבחר במסגרת מכרז והניהול והפיקוח נעשה ע"י שב"ס".
