בוגי יעלון הגיע למשבצת אותה שאף למלא- משבצת שר הביטחון.הוא ראה בעיינים כלות כיצד ברק מתמנה לשר ביטחון, ומה שנותר לו היה לתקוף אותו מימין. זה לא הפריע לו לעשות את אותם הדברים כאשר התמנה לשר הביטחון.
בוגי היה רמטכל בינוני, שהצטיין באמירות לא רציניות, כמו שעם הדעיכה המסוימת של פיגועי הטרור אמר "ניצחנו". לאחר מזאת הסביר כי הנצחון שלנו נצרב בתודעת הפלשתינים. נו באמת האם זה הפריע להם בהמשך? הוא לא השאיר את חותמו על הצבא, ולא בנה את הצבא למשימות עתידיות, אלא כוחו היה בשימור הקיים. הוא כרמטכ"ל התנגד להינתקות של אריק שרון אולם עסק בהכנות לקראתה כפי שנדרש מקציני הצבא, אולם לא קם והתפטר, אלא פוטר בזה שלא האריכו את כהונתו.
מלחמת לבנון השנייה הוכיחה כי הוא לא הכין את הצבא למלחמה, וחלוץ כשל בה. מה שלא הפריע לו לטעון כי לא הכנת הצבא לא הייתה רצינית אלא ניהול המלחמה על-ידי חלוץ והמטכ"ל. בניגוד למה שקרה לדדו שנאלץ לקצץ בצבא אולם ניצח במלחמת יום הכיפורים. ידועה גם אמרתו כי הוא הולך עם נעלים גבוהות מחשש מהנחשים במטכ"ל, לימים יטען כי התכוון לאזרחים ולא לאנשי הצבא.
אישיות לא רצויה
עם כניסתו לפוליטיקה בחר להצטרף לליכוד, טענתו הייתה כי מפאי או העבודה זנחו את הדרך של מקימיה, והוא נשאר מפאיניק אמיתי. הדברים חזרו אליו כבומרנג כאשר כשר ביטחון פינה מאחזים לא חוקיים וניהל יד קשה כנגד נערי הגבעות. ואז התחשבנו איתו
נפתלי בנט אביגדור ליברמן ובכירי הליכוד.
הוא טען שאין עם מי לעשות שלום כי הפלשתינים רוצים עוד ועוד עד שיחזרו ליפו עכו וכו. היה נגד מה שנקרא פתרוניזם דהיינו מציאת פתרונות אבל בפועל עשה זאת ועוד איך. במישור הדיפלומטי הסתכסך עם ארה"ב כאשר אמר כי מזכיר המדינה קרי נוהג במשיחיות, וננזף על כך והוכרז כאישיות לא רצויה בוושינגטון במהלך מספר שנים. לא הצליח לסגור תקציב רב שנתי ביטחוני לישראל באמריקה.
אמנם טוענים הפרשנים כי הוא הצליח לשמור על שקט יחסי בגזרות השונות, אולם המצב השתנה לחלוטין, את החיזבאללה דיכא אולמרט במלחמת לבנון השנייה הכושלת, ואחר כך ההסתבכות בסוריה של הארגון, במזרח אבו מאזן שומר על השקט כבסיס למדיניותו. בדרום מצרים ואסיסי עושים אותו דבר, כך שבמצב כזה אין תמה שהשקט נשמר.
עכשיו החליט על פרישה מהחיים הפוליטיים כשהוא זוכה לתמיכת השמאל, אבל כגדעון סער לפניו יש להניח כי גם הוא יחדול להיות פרסונה פוליטית, וישכח עד מהרה בציבור, כמאמר המשפט- פוליטיקה זה כמו גלגל, פעם אתה למטה פעם למעלה, אבל עליך להשאר על הגלגל. יצאת מהמשחק המשחק לא יחזיר אותך חזרה, אתה לא בן-גוריון שיקראו לך מאחורי המחרשה לחזור ולהנהיג את המדינה.