ההסבר שניתן להחלטה שלא לחקור באזהרה את ניצב ירון בארי בפרשת רונאל פישר, אינו מתקבל עד היום על דעתו של דובי שרצר, שהיה ראש צוות החקירה של מח"ש בפרשה. כך עולה מדבריו של שרצר (יום ה', 25.6.20) בסיום עדותו הראשית במשפט פישר.
בארי, שהיה ראש אגף משאבי אנוש וראש אגף התנועה, נחשד בקבלת שוחד מפישר באמצעות תרומות לעמותה בה הייתה פעילה אשתו. התיק הפלילי נגדו נסגר והוא הועמד לדין משמעתי. שרצר סבר שיש לחקור אותו באזהרה, אך פרקליט המדינה דאז, שי ניצן, החליט שהוא ייחקר כעד בלבד. שרצר הסביר, כי הנוהג היה שפרקליט המדינה מעורב בהחלטות הנוגעות לחקירת נציבים, וכי מי שפנו לניצן היו ראש מח"ש וסגנו דאז, אורי כרמל ומשה סעדה.
שרצר נשאל מדוע ברונו שטיין, לשעבר מפקד מחוז המרכז וראש אגף התנועה, נחקר באזהרה בפרשת פישר, בעוד בארי כאמור נחקר רק כעד. הוא השיב, כי הנימוק שניתן לו היה, כי שטיין קיבל על-פי החשד שוחד ישיר, בעוד במקרה של בארי מדובר היה כאמור בתרומה לעמותה. "אני לא מסכים עם ההסבר הזה, אבל לא יכול לשלול אותו", אמר שרצר, והזכיר את הפסיקה - לרבות בפרשת הולילנד, בעניינו של אורי לופוליאנסקי - לפיה גם תרומה יכולה להוות שוחד.
שרצר דחה את הטענות הצפויות של ההגנה בדבר מחדלי חקירה ואכיפה בררנית במהלך החקירה. הוא הסביר, כי הורה להחזיר את הפלאפונים של ערן מלכה ושל עדת המדינה ע"י, כי חוק המחשבים מאפשר זאת וכך נהגו החוקרים גם במקרים דומים. "היום, בדיעבד, הייתי משאיר את הטלפונים פה ומונע הרבה טענות", הוסיף. עוד אמר כי החוקרים לא בדקו את הטלפונים של השניים בסבב החקירות השני (אפריל 2015), משום שמדובר היה באותן פרשות שנחקרו שנה קודם לכן, ומשום כך סברו שלא ימצאו בהן מידע חדש. "בדיעבד טעינו", אמר שרצר בהתייחסו לפגישה הלילית בין המעורבים לאחר פריצת הטלפונים, בה לטענת המדינה הם פעלו לשבש את החקירה.
ברמת הרוחב הסביר שרצר, כי תמיד ניתן לבצע יותר פעולות, אך הוא התמקד בליבת הפרשה: העברת מידע בידי מלכה לפישר תמורת שוחד. פעולות אחרות לא היו אמורות להניב מידע, או שהיו מסובכות מאוד לביצוע, הוסיף.
עוד אמר שרצר כי היה לו ברור שאלון חסון ואילון מכלוף "יעשו הכל כדי לפרק את פישר. אבל יש מרחק רב בין זה לבין ליצור קנוניה ולהמציא עלילת שווא. האנשים שבאים למח"ש - לכולם יש אינטרס. התפקיד שלנו הוא לבדוק את מה שהם אומרים, ולראות אם יש דברים אחרים שתומכים בגרסה. החומר שאני ראיתי העלה שיש אמת בדבריהם, והמניע שלהם פחות עניין אותי".
