ביקורת חריפה מאוד על הדוח שפרסם במהלך השבת (20.6.20) מרכז המידע למערכה בקורונה המזהיר כי בימים אלה נכנסת ישראל לגל תחלואה שני בקורונה - המחייב נקיטת צעדים מיידיים לצמצום השלכותיו. יו"ר איגוד רופאי בריאות הציבור בישראל, הפרופסור חגי לוין, אמר כי הדוח מכיל שגיאות עובדתיות קשות. "נראה כאילו מישהו סימן מראש את המטרה והתאים לה את הנתונים. התמודדות מיטבית עם מגפה מחייבת מקצועיות ושקיפות. שני מרכיבים אלו חסרים בדוח. דוחות לא מקצועיים מסוג זה פוגעים לא רק במוכנות לפנדמיה אלא גם באמון הציבור. אני מעריך מאוד את היכולות המצוינות של חיילי אמ"ן, שחלקם אף חברים אישיים שלי מתקופת השירות הצבאי. אבל בדומה לשימוש הלא ראוי בכלי השב"כ כך השימוש באמ"ן למטרות בריאות הציבור, ללא בקרה מקצועית אפידמיולוגית, עלול גם לפגוע, לצערי הרב, באמון באמ"ן ובצה"ל".
להערכת מרכז המידע והידע, מצב העניינים הנוכחי עלול להוביל להחלטות כבדות משקל - בהן חידוש הסגר הכולל - וניתן להימנע מכך רק אם יינקטו צעדים מתונים בימים הקרובים.
לוין אף מתח ביקורת על חוסר השקיפות בפרסום הדוחות ואמר: "לא מקצועי ולא רציני, שיוצאים דוחות אפידמיולוגים מאמ"ן שאף איש לא חתום עליהם, קל וחומר שאף איש מקצוע מהתחום הרלוונטי לכך, היינו מתחום מדעי האפידמיולוגיה ובריאות הציבור. חוסר השקיפות בלתי מתקבל על הדעת. יש מרכז ידע שהוא לא שקוף, ולכאורה לפי הצהרתו אין שם בכלל מומחים באפידמיולוגיה או בריאות הציבור. הניתוח עצמו הוא לעיתים לא מקצועי, ולפעמים שגוי. לדוגמה, בדוח האחרון אין התייחסות דיפרנציאלית לפיזור התחלואה בארץ, ואין קשר ממשי בין הממצאים להמלצות. מעבר לכל זה, מונעים מגופים אחרים - שיש להם את הידע המקצועי - נגישות למידע. לא נורא שנותנים לחיילי אגף המודיעין (המצוינים כשלעצמם) נגישות למידע בריאותי. אבל חמור מאוד שמונעים מהאפידמיולוגים במרכז הלאומי לבקרת מחלות ומרופאי המחוזות גישה לנתונים הגולמיים".
בדוח נכתב כי הגל השני שונה במאפייניו מהגל הראשון, אך לא פחות ממנו בחומרתו. אם לא יינקטו פעולות כלשהן, מזהיר, וקצב הגידול הנוכחי בנדבקים לא יקטן באופן משמעותי, בעוד כחודש מספר הנדבקים החדשים היומי יחצה את האלף ומספר מקרי המוות הכולל יעמוד על מאות רבות.
על-פי המסמך, מצבנו טוב יותר לעומת הגל הראשון מבחינת מערכת הבריאות שערוכה יותר בהיבטים של ידע, פרוטוקולי טיפול וטיפולים תרופתיים. אלה יסייעו בהנמכת היקף התמותה כתוצאה מהנגיף. בנוסף, חל שינוי בגילי הנדבקים - דבר המשפיע על שיעור החולים במצב קשה בקרבם. בחודשים מרס ואפריל כ-13% מהחולים היו מעל גיל 65, ובחודשים מאי ויוני השיעור ירד ל-8.7%.
לעומת זאת, בגל התחלואה הקודם חלק משמעותי מהחולים החדשים נבע מחזרת ישראלים מחו"ל - אוכלוסייה שבמידה רבה הייתה נוחה יותר לזיהוי והכלה. בגל התחלואה הנוכחי מקור ההדבקה הוא בתוך הקהילה, ולכן קשה יותר להשתלט עליו. בנוסף, ההתנהגות הציבורית - אי-עטיית מסכות ושמירה על ריחוק חברתי - והן ההקלות, צפויים להאיץ את העלייה בנדבקים.
הפרופסור נדב דוידוביץ', ראש בית הספר לבריאות הציבור באוניברסיטת בן-גוריון, הצטרף לביקורת: "יושבים שם חיילים וקצינים, שבכל יום מחליטים האם לעשות סקירה בינלאומית, או ניתוח אחר. זו הגדלת הראש שלהם. הם אנשים יצירתיים מאוד עם כוונות טובות. הם תופסים נושא ולומדים אותו, ומוציאים דוח. יכול להיות שיש ראש ענף שמסתכל על זה, אבל לא בטוח בכלל שיש גורם רפואי מקצועי שבודק אותם. המסמך שפורסם הוא מסמך אסטרטגי עם המון משמעויות שנוגע לליבת העניין, ולא ייתכן שהוא יצא מבלי שמישהו מקצועי עבר עליו. זה סתם מייצר רעש והמולה.
הוא תהה מדוע חיילים הם אלו שאמונים על ניתוחים הנוגעים למגפה. "לא הם צריכים לעשות את זה. במקום לחזק את האגף לאפידמיולוגיה, האגף לבקרת מחלות וגופי המקצוע המשמעותיים, מי שממלא את החלל הם גופים כאלו. יש עכשיו חילופי דורות; המנכ"ל משה בר סימן טוב עזב, הפרשה של המשנה למנכ"ל איתמר גרוטו מייצרת רעש במערכת, והמנכ"ל החדש חזי לוי רק בהתחלה שלו, ויוצר לעצמו עכשיו את שיטות העבודה. משרד הבריאות מתקשה להרים את ראשו מעל המים ולחשוב קדימה, בגלל כל הלחץ וחילופי הדורות. לתוך החלל הזה נכנסים גופים שמההתחלה לא היו צריכים להיות שם. לאורך כל הדרך, מההתחלה, לא היה גורם אינטגרטיבי. התוצאה, בסופו של דבר, מעלה שאלות מקצועיות", דברי דוידוביץ'.