מנהיג המורדים הצ'צ'נים אשר לקח אחריות לטבח בבית הספר בבסלן ולהתקפות נוספות ברוסיה ב- 2004 במשך השנים האחרונות נהרג על-ידי הכוחות המיוחדים הרוסים, כך דיווחו גורמים רשמיים (יום ג', 11.7.06).
עם זאת, המורדים הבדלנים בדרום טוענים כי שמיל בסאייב מת כשמשאית שהעבירה חומרי נפץ התפוצצה בטעות. בטלוויזיה הרוסית דווח כי ניקולאי פטרושב, העומד בראש שירותי הביטחון (FSB) דיווח לנשיא, ולדימיר פוטין, על מותו של מנהיג המורדים: "הלילה, מבצע מיוחד בוצע... במהלכו שמיל בסאייב... חוסל".
פוטין בירך את פטרושב ואת כל המעורבים בתכנון וביצוע המבצע. "זהו עונש מוצדק לפושעים, עבור הילדים שלנו בבסלן, בבודיונובסק, לכל התקפות הטרור שהם ביצעו במוסקבה ובאזורים אחרים ברוסיה, כולל אינגושטיה והרפובליקה הצ'צ'נית", דברי הנשיא.
המורדים הצ'צ'נים אישרו את מותו של המנהיג אך הכחישו כאמור כי הכוחות הרוסים הם שאחראים לכך. "המפקד הצ'צ'ני מת כתוצאה מתאונת פיצוץ משאית שהעבירה חומרי נפץ ב- 10 ביולי, סמוך לכפר אקזהבו, באינגושטיה", כך נאמר בהודעה שפורסמה באתר האינטרנט Kavkazcenter.com.
בשיר אשב, סגן ר"מ אינגושטיה, אמר כי בסאייב היה בין החשודים הצ'צ'נים שנהרגו בשעה שישבו ברכבם שעמד סמוך למשאית עמוסה בחומרי נפץ שהתפוצצה בכפר יקזהבו. גופתו של בסאייב זוהתה בעזרת זיהוי חלקים ממנה שנותרו לאחר הפיצוץ העז, כך דווח. הרשויות לא פרסמו תמונות של גופתו של בסאייב, אך נותר ספק קטן מאד כי אכן מדובר במנהיג המורדים הצ'צ'ני. "סילוקו של בסאייב הוא הצלחה שלא תאמן", אמר רמזן קדיירוב, ר"מ צ'צ'ניה. "אני רק מצטער שלא יכולתי לקחת חלק בחיסולו בעצמי. הוא לא היה רק אויב של כל החברה הרוסית אלא גם שלי באופן אישי... הוא היה טרוריסט בקנה מידה בינ"ל".
בספטמבר 2004 השתלטו טרוריסטים צ'צ'נים על בית ספר בעיירה בסלן ולקחו כבני ערובה מאות תלמידים ואנשי סגל בית הספר. כחלק מפעולת החילוץ במקום הסתערו כוחות קומנדו של צבא רוסיה על בית הספר, שבו החזיקו כ-30 חוטפים מאות בני ערובה, וזאת לאחר שהצ'צ'נים החלו לירות לעבר הילדים.
במהלך ההסתערות ירו הכוחות גם בבני הערובה. חלק מתיקרת אולם ההתעמלות בבית הספר קרסה מפיצוץ מטען של הצ'צ'נים. עקב הפיצוץ פרצה אש עזה. התיקרה התמוטטה וקברה תחתיה חלק מהחטופים. עשרות ילדים שהיו במקום לא הצליחו להימלט. אלה שלא נפגעו מהתיקרה שקרסה, נשרפו חיים. כוחות החילוץ הוציאו לאחר מכן את גופותיהם כשהן מפוייחות.