פרקליטות המדינה הודיעה (ד', 26.7.06) לבית משפט השלום בת"א, בו מתנהל תיק בעניינו של פרופ' ציון בן-רפאל ב"פרשת הביציות" כי הצדדים הגיעו להסכמה לפיה תוגש בימים הקרובים קובלנה מוחמרת נגד פרופ' בן-רפאל לשר הבריאות. במסגרת הסדר הטיעון יודה בן רפאל בעבירות משמעת של התנהגות שאינה הולמת רופא ובהפרה של הוראות חוק זכויות החולה ויוטל עליו העונש המוסכם של שלילת הרשיון, כאשר העונש ייקבע באופן סופי על-ידי ועדת המשמעת במשרד הבריאות שאמורה לדון בקובלנה החדשה שתוגש נגד בן רפאל.
ראשיתה של הפרשה באמצע שנת 2000, כאשר נשים שעברו טיפולי פוריות ושאיבת ביציות על-ידי גינקולוגים בכירים בבתי החולים הפרטיים אסותא בתל אביב והמדיקל סנטר בהרצליה, אושפזו במצב קשה שסיכן את חייהן. על-פי החשד שעלה אז, אותם גינקולוגים שאבו מהנשים מספר ביציות גדול מזה שהוסכם עליו לפני השאיבה, ומכרו אותן ללא ידיעת המטופלות.
בחודש מרס 2001, הוחלט בפרקליטות מחוז תל אביב להגיש כתבי אישום נגד שני החשודים המרכזיים, פרופ' ציון בן-רפאל וד"ר יעקב אשכנזי וכן נגד מנהל היחידה להפריה חוץ-גופית במדיקל סנטר בהרצליה, ד"ר אבי קוגוסובסקי, בשורה של עבירות חמורות ובהן: קבלת דבר במרמה, מרמה והפרת אמונים, גניבה ביד מורשה, זיוף, קשירת קשר לרישום כוזב ועוד.
צוות מיוחד שהוקם בפרקליטות קבע מאוחר יותר, כי יש לסגור את התיק נגד בן-רפאל, אלא שהיועץ המשפטי לממשלה, מני מזוז קיבל את הערר שהגישו המטופלות וקבע כי הפרופסור יואשם בעבירות של קבלת דבר במרמה בנסיבות מחמירות, שידולי מרמה ושיבוש מהלכי משפט.
"באמצעות שידולי המרמה המתוארים לעיל, שכנע הנאשם במרמה ושלא כדין את ד.צ להסכים לתרום ביציות ולחתום על טופס הסכמה לתרומת ביציות. לו ידעה ד.צ. שבכוונת הנאשם ליטול ממנה ביציות בשיעור ובכמות גבוהים מהמצג אותו הציג בפניה כמתואר לעיל, ולתתן למספר רב של נשים בארץ, לא היתה נותנת את הסכמתה לתרומת ביציות", נכתב בכתב האישום שהוגש נגד בן-רפאל.
לאחרונה פנו באי כוחו של פרופ' בן-רפאל וביקשו להעביר את ההתדיינות למישור המשמעתי בהתאם להתניות שקבע מלכתחילה היועץ המשפטי לממשלה בעבר.
בהודעת משרד המשפטים נאמר, כי "בנסיבות העניין סבורים היועץ המשפטי לממשלה ופרקליט המדינה כי בהסכמה המתוארת יש כדי ליתן מענה הולם לסיום פרשה זו. עובדות הקובלנה ועונש התליית הרישיון מבטאים את חומרת מעשיו של פרופ' בן-רפאל ואת הפגיעה במתלוננות". עוד נמסר כי אחד השיקולים להסכמה לביטול כתב האישום היה הודאתו הראשונה של בן רפאל במעשים המיוחסים לו.
הקובלנה המוחמרת שתוגש נגד בן-רפאל כוללת שש פרשיות בהן מיוחסות לו, בין היתר, עבירות של מתן טיפול רפואי ללא הסכמה מדעת על-פי חוק זכויות החולה, והתנהגות שאינה הולמת רופא מורשה על-פי פקודת הרופאים. עם זאת, עורכי דינו של בן-רפאל, ד"ר יעקב וינרוט ופרופ' דוד ליבאי, טוענים כי לבן-רפאל לא מיוחס כל פגם בטיפול הרפואי שהעניק למטופלות.
בעקבות חתימת ההסדר, הודיע בן-רפאל לבג"צ על משיכת עתירתו כנגד אופן הגשת כתב האישום נגדו בידי הפרקליטות, תיק שכבר נסגר מוקדם יותר בחתימת ידן של לא פחות מחמש פרקליטות בכירות.
