מספר שעות לאחר פגיעת המטוס הראשון באחד ממגדלי התאומים, מתברר כעת כי דקות ספורות לפני הפגיעה קיבל עורך הדין, טד אולסון, דיווח מאשתו ששהתה על אחד המטוסים. טד אולסון הוא עורך הדין אשר ייצג את בוש לאחר הבחירות.
על-פי הדיווח, השתלטו על המטוס מחבלים באמצעות סכינים בלבד. הסכינים הוברחו למטוסים למרות האבטחה, דבר שהיה קשה יותר לעשותו לו היה מדובר בנשק חם.
המחבלים הצמידו לטייסי המטוס סכינים וריכזו אותם ואת כל הנוסעים בצידו האחורי של המטוס. אחד המחבלים השתלט על המטוס. ככל הנראה, לא הבינו נוסעי המטוס כי בכוונת המחבלים לפוצצו, אלא העריכו שילקחו למדינה ערבית כחטופים. מסיבה זו לא התנגדו אלא העדיפו לאפשר לחוטפים להנחית את המטוס.
המחבלים, אשר השתלטו על המטוס, הטיסו אותו ישירות לתוך מגדל התאומים הראשון, וכלל הנראה הרגו את עצמם ואת כל הנוסעים מיידית.