חטיבת גולני השלימה אחר-הצהרים (יום ה') את השתלטותה על העיר ג'נין והטילה עוצר על העיר. מצה"ל נמסר, כי זהו מבצע שייארך כמה ימים ומטרתו - פעילות נגד תשתיות הטרור, סיכול כוונות להוצאת פיגועים מן האזור לשטח ישראל, תפיסת אמצעי לחימה ומעצר מבוקשים. המבצע קיבל את השם - "תיאום כוונות".
במהלך הפעילות גילו כוחות צה"ל ג'יפ חדיש - מסוג ג'י.אמ.סי, ובו מטען ענק של חומר נפץ. זמן קצר לאחר מכן פוצץ המטען פיצוץ מבוקר. במערכת הביטחון סבורים, כי הג'יפ אמור היה לחדור לשטח ישראל, ולבצע פיגוע תופת באזור מיושב. על-פי המידע שבידי צה"ל, הפיגוע תוכנן לביצוע בזמן החגים. פעילי הג'יהאד האיסלמי שתיכננו לבצע את הפיגוע, נלכדו.
בשעות הצהרים דיווחו מקורות פלשתינים על שני פלשתינים פצועים. עשרות צעירים ידו אבנים לעבר החיילים, אשר השיבו באש חיה ובגז מדמיע. במהלך הפעילות נעצרו ארבע פעילים של הג'יהאד האיסלמי והתנזים.
במהלך ליל יום ד' נכנס כוח צה"ל למחנה הפליטים נוציראת ברצועת עזה, במטרה להרוס תשתיות של החמאס. במהלך פעילות הכוח, נפתחה לעבר כוח צה"ל אש ומהומות התעוררו במקום. צה"ל השיב באש, וכתוצאה מכך חוסל מבוקש, מהחמאס - ג'יהד אבו-סווריח.
במהלך הפעילות כיתרו הכוחות את ביתו של אבו-סווריח על-מנת לנסות ולעצרו. המבוקש החל להימלט ופתח באש לעבר הכוח, ממנה נפצעו שני חיילי צה"ל, האחד באורח קשה והשני באורח קל. המבוקש, כאמור, נהרג במהלך חילופי האש, וגופתו נתגלתה בסריקות שנערכו בבית בתום הפעילות.
לקראת סיום הפעילות פתחו מחבלים חמושים באש והפעילו מטענים לעבר כוחות צה"ל, מהם נפצע חייל נוסף באורח קל מאוד. החייל קיבל טיפול רפואי במקום. הכוחות השיבו באש לעבר מקורות הירי במרחב בסיוע מסוק קרב, שירה לעבר שטחים פתוחים. עם סיום הפעילות יצאו הכוחות ממרחב מחנה הפליטים.
במהלך הלילה עצר צה"ל 8 מבוקשים לחקירה בשכם, ג'נין ובית לחם.
צה"ל ממשיך לפעול בשטחים במטרה לסכל פיגועים. כוח מגדוד הנחל החרדי, כשהוא מלווה בסיירת חטיבה 500, הצליח הלילה לעצור בכפר טובאס שלושה פעילי טרור: שני מחבלים - מחבלת ומחבל, שעמדו לבצע פיגועים: המחבלת, ג'יהאד דרג'מה, עמדה לבצע פיגוע התאבדות. מחקירתה התברר כי היא אחותה של המחבלת המתאבדת שפוצצה עצמה בפיגוע בקניון בעפולה לפני כארבעה חודשים.
המחבל, מוחמד גרייב, פעיל ג'יהאד איסלמי, עמד לצאת לפיגועי ירי נגד מטרות צבאיות. המחבל השלישי שנעצר עסק בארגון ובשילוחם.