בית המשפט הגבוה לצדק דחה (יום ב', 29.9.03) את העתירה שכוונה נגד ראש המחלקה לחקירות שוטרים במשרד המשפטים (מח"ש), פרקליט מחוז ירושלים ו-4 משיבים נוספים (כולל ראש השב"כ), בה נדרשו המשיבים להורות למח"ש לפתוח בחקירה נגד שוטרים, שלטענת העותר גבו ממנו הודאה בביצוע רצח תוך שימוש באלימות.
העותר, יעקוב עליוואת, הועמד לדין בבית המשפט המחוזי בירושלים בעבירות של רצח ושיבוש הליכי משפט. בחקירתו במשטרה, מסר הודאה מפורטת ברצח, אך עשרה ימים לאחר הגשת כתב האישום נגדו, פנה לראש מח"ש בדרישה לפתוח בחקירה נגד חוקריו, בטענה שבמהלך חקירתו הפעילו החוקרים אלימות כלפיו, ושההודאה ברצח הוצאה ממנו בדרכים פסולות.
במקביל, מנהל העותר הליך של "משפט זוטא" במסגרת המשפט המתנהל נגדו - כלומר בירור סוגיית חופשיות הודאתו במשטרה לצורך הרשעה בבית המשפט.
דרישת העותר לפתוח בחקירה נגד החוקרים נדחתה על-ידי מח"ש, בנימוק שההליך הנכון לבירור טענות האלימות הוא משפט הזוטא. עוד טענו במח"ש, כי אם יעלו בבית המשפט חשדות לביצוע עבירה פלילית בידי החוקרים, גם היא תפתח בחקירה. ערר שהגיש העותר נגד החלטת מח"ש נדחה על-ידי פרקליטות המדינה, בכפוף לעובדות חדשות שיתגלו במהלך משפט הזוטא.
בהחלטתו לדחות את העתירה קבע השופט מישאל חשין, שבדרך כלל "אין זה ראוי כי חקירה באותו נושא עצמו - בענייננו: שאלת האלימות שהפעילו, או שלא הפעילו, אנשי המשטרה כלפי העותר - תידון בה-בעת לפני שני גופי שלטון: לפני בית המשפט במשפט זוטא ולפני מח"ש".
הנימוק לכך, לפי חשין הוא, החשש שכפילות כזו תקשה על ניהול המשפט הפלילי: "נקל להבין מה תוהו-ובוהו עלול להשתרר בהליכי משפט פלילי מקום שמתנהל משפט זוטא בטענת נאשם כי הודאתו במשטרה הוצאה ממנו באלימות, ובה-בעת חוקרת מח"ש באותה טענה. ואילו אם נאמר כי חקירת מח"ש תבוא תחילה ומשפט הזוטא יבוא לאחריה, במו ידינו נעכב הליכי משפטים פליליים בלא הצדק ראוי לדבר".
חשין סייג את דבריו, וקבע כי בנסיבות חריגות ניתן יהיה לאפשר חקירת מח"ש לפני קיום משפט הזוטא, אך הוסיף שלא זה המצב במקרהו של העותר. הוא הוסיף, כי אם יתגלה במשפט הזוטא דבר המצדיק חקירה נוספת בעניין האלימות שהפעילו החוקרים נגד העותר לטענתו, שמורה לו הזכות לחדש את תלונתו במח"ש.
בג"צ 5413/03 עליוואת נ' ראש מח"ש ואח'