ממשלות ארצות הברית, הן של הנשיא הנוכחי גורג' בוש, והן של הנשיא לשעבר, ביל קלינטון, מואשמות בכך שנכשלו ולא פעלו בעקבות האיום שהיווה ארגון אל-קאעידה.
בשימוע של הקונגרס בנושא הפיגוע ב-11 בספטמבר, נאמר כי קלינטון שקל 3 פעמים לפתוח בתקיפה על אוסאמה בן-לאדן, אך חזר בו בכל אחת מן הפעמים, מחשש לאבידות בנפש של אזרחים.
לנשיא בוש נמסר מידע מודיעני שהצביע כי יש להגביר את ההאזנות בין חשודים בפעילות טרור, בעקבות אזהרות בהולות שנשמעו מגורמים רשמיים בנושא הטרור במהלך הימים המוקדמים של כהונתו. אף לא אחד מהם פעל באופן מיידי, כך נאמר בשימוע בקונגרס.
ראיות מגורמים בכירים משתי הממשלות חשפו גם, כי ביום שלפני ה-11 בספטמבר 2001, יזמה ארצות הברית תוכנית להפלת הטאליבן, שנתנה מחסה לבן-לאדן באפגניסטן. שר ההגנה, דונלד רמספלד אמר, כי לא האמין כי הריגתו של בן-לאדן לפני ה-11 בספטמבר היתה מונעת את הפיגוע.
הוועדה מצאה, כי ממשל קלינטון ידע כבר בשנת 1995 כי בן-לאדן, ומי שהיה ה'מוח' מאחורי הפיגוע ב-11 בספטמבר, חאליד שייח מוחמד, היו קשורים שניהם לטרור העולמי.
השימוע נערך בתקופה פוליטית בעייתית לנשיא בוש, שביום שלישי נאלץ לסתור בציבור את האשמות שנשמעו מיועץ הביטחון לשעבר, כי התעלם מאזהרות בדבר האיום של אל-קאעידה.