הממשלה אישרה הבוקר (יום א', 13.6.04) את הצעת השרה לאיכות הסביבה, פרופ' יהודית נאות - שימור אתר מצדה. להצעתה הצטרפו שרת החינוך, התרבות והספורט, שר התמ"ת ושר התיירות.
הממשלה ציינה, כי היא רואה צורך בשימור והגנת האתר מפני נזקי טבע ובלאי, מתוך הכרה בחשיבותו ההיסטורית, הערכית, התרבותית, החינוכית והתיירותית.
השרה לאיכות הסביבה פרופ' נאות: "אני רואה חשיבות רבה בהכרה הערכית, ההיסטורית, התרבותית, החינוכית והתיירותית של אתר "מצדה". החלטת הממשלה באה להבטיח את השימור וההגנה עליו מפני נזקי טבע ובלאי".
בין החלטות הממשלה: - יוקם צוות מנכ"לים בראשות המשרד לאיכות הסביבה לצורך הכנתה ואישורה של תוכנית לשיקום הנזקים שנגרמו לאתר מצדה בשיטפונות החריגים של דצמבר 2003.
בצוות יהיו חברים: משרד האוצר, משרד התיירות, משרד החינוך, משרד התמ"ת, הוועד הישראלי לאונסק"ו, רשות הטבע והגנים ורשות העתיקות לצורך
- הצוות יכין תוכנית ארבע שנתית להצלת ערכי המורשת הנמצאת בסכנת הריסה;
- הצוות יצביע על מקורות תקציביים למימוש התוכנית;
- הצוות ידווח לממשלה אחת לשנה על התקדמות ביצוע התוכנית ומצבו של האתר.