בקהיר חוששים מפני אפשרות שישראל תקים תחנת כוח גרעינית (תג"ר) לייצור חשמל באזור שיבטה בדרום, כ-20 ק"מ מהגבול המצרי.
הסכנות הטמונות בהקמת תחנת כוח גרעינית הן כדלקמן: תאונה גרעינית, דליפה רדיו-אקטיבית, סילוק פסולת גרעינית וזיהום תרמי (שינוי באיכות מאגר מים מקומי).
גורמים מצרים אומרים (ב', 2.8.04), כי משרד החוץ המצרי מינה צוות הפועל בישראל, במטרה לעקוב מקרוב אחר ההיבטים השונים של הצעדים הישראליים לקידום הפרוייקט, והשלכותיו.
מדוח ראשון שפרסם הצוות המצרי עולה, כי עלות תחנת הכוח הגרעינית נאמד בכשני מיליארד דולר ועבודות ההקמה יחלו בעוד שלוש שנים, במהלך שנת 2007. כמו כן נמסר, כי התחנה תחל לפעול בשנת 2020 והיא תשמש למטרות שלום.
עם זאת, מסכם הצוות המצרי, אין כל ערובה רשמית לכך שהתחנה לא תוסב לצרכים צבאיים. עוד נמסר בדוח, כי ישראל מנהלת מגעים עם הרוסים במטרה לרכוש את הטכנולוגיה להקמת התחנה, לאחר שגרמניה סירבה לייצא טכנולוגיה גרעינית לישראל ומשהתברר כי הטכנולוגיה הצרפתית אינה מתאימה.
לדברי אותם גורמים, מצרים מתכוונת לדרוש מהסוכנות הבינלאומית לאנרגיה אטומית (סבא"א) להכפיף את התחנה לפיקוח בינלאומי. בנוסף, קהיר צפויה לדרוש מישראל ערבויות לכך, שהתחנה לא תשפיע באופן זה או אחר על איכות הסביבה במצרים, וכי לא יסולקו שפכים בסמוך לגבול.
קהיר מגבירה את הלחץ זה תקופה ארוכה שמצרים נמצאת בחוד-החנית של הקמפיין הערבי-מוסלמי הדורש להחיל את כללי הפיקוח הבינלאומיים על הכורים הגרעיניים של ישראל ולהתחייבות ישראלית לאמנת ה-NPT [האמנה למניעת הפצת נשק גרעיני], עליה חתומה בין היתר קהיר עצמה. החזית שמנהלת קהיר מול ישראל בסוגיית כור הגרעיני בדימונה מתרחבת היום, אם כן, לערוץ נוסף.
תחנת כוח גרעינית, אגב, נבדלת מתחנת כוח אחרת בכך שחומרי הדלק המשמשים אותה - הינם חומרים רדיו-אקטיביים (בדר"כ אורניום או פלוטוניום). בעולם פועלות כיום כ-400 תחנות כוח גרעיניות המייצרות כ-15% מתצרוכת החשמל העולמית. צרפת ובלגיה מפיקות כ-70% מתצרוכת החשמל שלהן בתחנות כוח גרעיניות.
משרד האנרגיה ופרוייקט תחנת הכוח הגרעינית בסעיף 5 בדוח של משרד האנרגיה בנושא "אנרגיה - מדיניות משק האנרגיה בישראל - גורמים המשפיעים על תכנון משק החשמל - מבוא וקריטריוני-על לתכנון", נמסר, כי תישמר עתודת קרקע באזור שיבטה להקמת תחנת כח גרעינית.
בדוח אחר נמסר, כי אחד היעדים המרכזיים בעניין זה הוא ביצוע סקר אתרים עבור תחנת כח גרעינית עתידית באזור שיבטה, לרבות איפיון ובחינות התאמת השטח לקריטריונים סיסמוגיאולוגיים, דמוגרפיים ואחרים.
בנובמבר 2002 הורה שר התשתיות דאז, אפי איתם, לקדם את ההליכים הנדרשים להקמת תחנת כוח גרעינית באזור שיבטה בנגב. בארגונים למען איכות הסביבה מחו בשעתו על ההנחייה.
עם זאת, לפני כארבעה חודשים, ובתום פגישה עם ראשי הארגונים לאיכות הסביבה, "מגמה ירוקה" ו"אדם טבע ודין", הדגיש שר התשתיות לשעבר, יוסף פריצקי, כי הוא מתנגד עקרונית להקמת תחנת כוח גרעינית. בינתיים נראה, כי התוכנית רובה ככולה תקועה ולוטה בערפל.