מאז שפרצה האינתיפאדה בחודש ספטמבר 2000, פתחה המשטרה הצבאית 600 תיקי חקירה נגד חיילי צה"ל בחשד לעבירות נגד פלשתינים, מהם כ-88 תיקים בחשד לירי בלתי חוקי של פלשתינים.
נתונים אלה נמסרו בוועדת החוקה, חוק ומשפט של הכנסת, על-ידי הפרקליט הצבאי הראשי היוצא, האלוף מנחם פינקלשטיין.
הפרקליט הצבאי הראשי מסר, כי מתוך 600 תיקי החקירה, הוגשו 90 כתבי אישום נגד חיילים בעבירות שונות: 34 על עבירות רכוש, 23 על עבירות אלימות, 22 על עבירות ירי ו-11 על עבירות אחרות. מכל אלה - 56 חיילים הורשעו בעבירות.
כאמור, תיקי החקירה החמורים יותר נוגעים להרג פלשתינים. הפרקליט הסביר לחברי הכנסת, כי ריבוי תיקי חקירה אין בהם כדי להעיד על הריגת פלשתינים שלא כדין על-ידי חיילים, אלא על המדיניות המחמירה מצד הפרקליטות הצבאית: לחקור כל תלונה נגד חיילים, גם את אלה המוגשות מצד משפחות ההרוגים הפלשתינים.
