אוסטרליה הודיעה כי תשקול לחתום על הסכם ביטחון חדש עם אינדונזיה, אשר יחליף את ההסכם שבין השתיים אשר לא מומש, במיוחד לאחר שקנברה שלחה את כוחותיה למזרח טימור ב-1999.
בשנה שעברה קרא הנשיא הנבחר האינדונזי, סוסילו במבנג וידהויונו, לחידוש ההסכם, במסגרת ביקורו באוסטרליה, אך לדברי שר החוץ האוסטרלי, אלכנסדר דאוונר, ינוסח ככל הנראה הסכם חדש ולא ייעשה שימוש במה שכינה "מסמך חדש שימוש".
יש לציין, כי נשיא אינדונזיה נבחר רק לפני מספר ימים, והחליף את הנשיאה היוצאת, מגאואטי. אני אסדר מחדש את הממשלה הבאה ותוכנית ל-100 הימים הראשונים, ואז אסביר לעם מה הממשלה באמת עושה", כך אמר עוד לפני שהוכרזו התוצאות הרשמיות של הבחירות [ראו קישור].
שר החוץ האוסטרלי אמר בראיון לחדשות ערוץ 9 באוסטרליה, כי "נבחן מעין הסכם חדש והסכם גבול עם אינדונזיה... אך לא הגענו לשום החלטה האם נקיים מו"מ להסכם כזה או לא, אך אנחנו שוקלים זאת, ולוקחים בחשבון את מה שאמר במבנג יודהויונו".
דאונר אמר כי הסכם חדש חייב לכלול תזכיר של הבנה בין שתי המדינות בנושא המלחמה בטרור. ככל הנראה, הוסיף, הנושא של שליחת הכוחות האוסטרלים לדרום מזרח אסיה, לא יעלה בשיחות שיקיים ראש הממשלה, ג'ון הווארד, עם יודהויונו, בפגישתם ביום ד'. דאונר הדגיש, כי הוא בטוח ביחסים הטובים שיתפתחו בין שתי המדינות, תחת שלטונות של המנהיג האינדונזי החדש. "הוא מחויב לנקוט בעמדה חזקה נגד הטרור, נגד ג'מעה אל-איסלמייה, הוא מחויב להיות מאד יעיל, מאד בונה במערכת היחסים עם אוסטרליה".
שתי המדינות ביססו שיתוף פעולה במלחמה בטרור מאז הפיגוע בבאלי ב-2002, בו מתו 202 איש, בהם 88 אוסטרלים.