מזכ"ל האו"ם, קופי אנאן, נחקר בחשד למעורבות בשערוריית "נפט עבור מזון".
שמו של קופי אנאן הוזכר כמי שמעורב בפרשה המביכה. הוא נחקר (יום ג', 25.1.05) לגבי מידת מעורבותו וידיעתו באשר לנסיבות האירועים סביב תוכנית "נפט עבור מזון". על-פי הפרטים שנחשפו בהדרגה במהלך השנה האחרונה, ניצל סדאם חוסיין תחת עינו הפקוחה של מזכ"ל האו"ם את התוכנית ההומניטארית שיזם האו"ם "נפט בעבור מזון", בכדי להבריח למעלה מ-17.3 מיליארד דולר בכספי נפט שנועדו מלכתחילה למטרות הומניטריות, בכדי להמשיך ולממן עם כסף זה טרור, יבוא נשק, וקניית השפעה בקרב חברות מועצת הביטחון צרפת, רוסיה וסין.
השאלה המרכזית שנשאלה בפרשה זו היא, כיצד נרדם ארגון האו"ם והעומד בראשו קופי אנאן בשמירה, ובמיוחד כיצד הצליח סדאם חוסיין במשך שנים לעקוף בצורה כה בוטה וקלילה את החרם שהוטל עליו במאמצים רבים על-ידי מועצת הביטחון של האו"ם.
כל זאת בתמורה למתן שוחד לחלק מהמעורבים הבכירים בתוכנית. לדברי דובר האו"ם, לא מן הנמנע כי מזכ"ל האו"ם ייחקר שוב בעתיד.
לאחרונה נחשף כי גם בנו של אנאן, קוג'ו אנאן, היה מעורב עד צוואר בתוכנית, ואף הסתיר פרטים שונים לגבי התקשרותו החשודה עם החברה השוויצרית שהפעילה את התוכנית. קוג'ו כך נחשף לאחרונה, בניגוד להצהרותיו ולהצהרות האו"ם שהסתמכו עליהן, המשיך לקבל במשך 5 שנים תשלומים סדירים מהחברה השוויצרית ולמעשה קיבל תשלומים ממנה במשך 9 שנים ברציפות עד חודש פברואר האחרון.
חשיפה זו הצריכה אפילו את מזכ"ל האו"ם לצאת בתגובה יוצאת דופן בה התוודה כי הוא "מופתע ומאוכזב שבני לא גילה לי כי הוא המשיך לקבל תשלומים מהחברה השוויצרית Cotecna".
עד החשיפה היה ידוע כי אנאן הצעיר קיבל פיצויים רק במשך שנת 1999 ולא יותר וזו גם הייתה גרסת האו"ם עד הלום. יתרה מכך "הוול-סטריט ג'ורנל" חשף בחודש ספטמבר השנה כי כבר בשנת 1999 השתמש קוג'ו אנאן בכרטיס האשראי של החברה השוויצרית.
המעניין הוא שההאשמות על מעורבותו של קוג'ו אנאן בחברה השוויצרית עלו כבר זמן קצר לאחר שהיא נבחרה בתחילת 1999 על-ידי האו"ם להחליף חברה בריטית במלאכת הפיקוח על התוכנית ההומניטרית. ההאשמות אז עסקו בכך ש-Cotecna נבחרה למרות שלא נתנה את ההצעה הטובה ביותר והמשתלמת ביותר עבור האו"ם. נטען אז כי למעורבות בנו של מזכ"ל האו"ם בחברה הייתה השפעה מכרעת על בחירתה.
אולם דובריו של מזכ"ל האו"ם הדפו אז טענה זו באומרם, כי קוג'ו סיים לעבוד עם החברה עוד בדצמבר 1998 ולכן כל הטענות על ניגודי אינטרסים של קופי אנאן, או על תשלומים מתחת לשולחן הם מופרכים ומשוללי כל יסוד - טענה זו כאמור, הוכחה כלא נכונה.