הודעה רשמית על מותו הוותיקן הודיע רשמית, סמוך ל-23:00 (שעון ישראל), על מותו של
האפיפיור - יוחנן פאולוס השני. כ-60 אלף מתפללים התגודדו בעת מותו בכיכר פטרוס הקדוש בתפילה להחלמתו. מיליארד קתולים אבלים עתה על מותו. תקופת האבל הנהוגה היא תשעה ימים. הצפי עתה הוא שהלוויה תהא ביום שלישי.
ההודעה הרשמית מטעם הוותיקן נמסרה על-ידי הדובר חואקין נבארו-ולס. נאמר בה: "האב הקדוש הלך לעולמו הערב בשעה 21:37 בדירתו הפרטית בוותיקן". כמו כן נמסר, כי החלו ההליכים למינוי אפיפיור אחר, וזאת בהתאם לחוקת הוותיקן שהותקנה על-ידי יוחנן פאולוס השני ביום 22.2.96.
בשתי היממות האחרונות עקבו רבים בדאגה ובדריכות לקראת ההודעה שהיתה צפויה, נוכח מחלתו הקשה. במהלך סוף השבוע התפללו עשרות מיליונים לשלומו. רבים אחרים - בני דתות אחרות, עקבו בעניין אחרי האירועים הדרמטיים.
מעט אחרי השעה 20:00 (שעון ישראל) מסרו מקורות רפואיים בוותיקן, כי האפיפיור מצוי במצב מתקדם של אובדן הכרה. דובר הוותיקן, רופא במקצועו, מסר כי מדובר במצב בלתי הפיך.
דובר הוותיקן מסר (ו', 1.4.05) כי האפיפיור מתקשה לנשום ולבו וכליותיו פסקו מלעבוד. "שוחחתי עם הרופאים, והם אמרו לי כי אין עוד תקווה" - אמר (שבת) ראש מחלקת הבריאות בוותיקן, קארדינל חוויאר לוזנואל. בתידרוך מיוחד בצהרים אמר דובר הוותיקן "מצבו נותר כשהיה, אך ניכרים בו סימנים ראשונים של איבוד הכרה. כשמשוחחים עמו, הוא פוקח את עיניו".
שורה של מינויים בוצעו טרם חלה ההדרדרות החמורה במצבו הספיק האפיפיור למנות 17 הגמונים וארכי-הגמונים חדשים והדיח שישה אחרים. רבים מ-183 קרדינלי הכנסייה הקתולית ברחבי העולם כבר יצאו לוותיקן. קרדינלים אלה יקבעו את נהלי ההלוויה והטקסים שייערכו במהלך תשעת ימי האבל. בשבוע השלישי מאז מות האפיפיור יתכנסו הקרדינלים כדי לבחור אפיפיור חדש שיהיה אחד מ-117 הקרדינלים שגילם אינו עולה על 80.
הקרדינלים ייפגשו מדי יום כדי ויצביעו באמצעות פתקי הצבעה. כל עוד לא יושג רוב למועמד זה או אחר ישרפו פתקי ההצבעה ויעלו עשן שחור כדי שהציבור הממתין בחוץ יידע שאין עדיין הכרעה. כשתושג ההכרעה וייבחר האפיפיור החדש יעלה בארובה עשן לבן.
"שינה את נשמתה של הכנסייה" יהודי איטליה ופולין ערכו ערב שבת (ו', 1.4.05) תפילות מיוחדות להחלמתו של האפיפיור יוחנן פאולוס השני, על-אף שכבר היו ידיעות על כך שהאפיפיור כבר החזיר נשמתו לבורא. "לנו, ליהודים, יחס מיוחד לאפיפיור", אמר רבם הראשי של יהודי פולין. "אנו מודים לו על כל מה שעשה עבורנו. האפיפיור יצר אוירה בה יהודי פולין יכולים לשוב למדינה".
בבית הכנסת הראשי בורשה התכנסו כמה עשרות לתפילה מיוחדת להחלמת האפיפיור, יליד פולין, שקטע רצף של 450 שנות אפיפיורים ממוצא איטלקי.
הקהילה היהודית ברומא ערכה גם היא תפילה מיוחדת לשלומו של האפיפיור בהשתתפות רבה הראשי של רומא, שמואל ריקרדו די-סני ונשיא הקהילה לאונה פסרמן.
"האפיפיור יוחנן פאולוס השני שינה את נשמתה ורוחה של הכנסייה הקתולית", אמר די-סני. "הוא פעל נגד אנטישמיות ולמען דיאלוג בין שתי הדתות".
נשיא איחוד הקהילות היהודיות של איטליה, עמוס לוצאטו אמר לעיתון האיטלקי, לה רפובליקה: "אפיפיור זה עשה יותר מכל קודמיו למען העם היהודי. במיוחד זכורים ביקורו ההיסטורי בבית הכנסת ברומא, כינון הקשרים הדיפלומטים עם ישראל וביקורו בכותל המערבי". משלחת מיוחדת של ראשי יהדות איטליה יצאה לוותיקן כדי לחזק את בני הקהילה הקתולית בשעתם הקשה.
מנהיגי העולם מיהרו כבר הלילה
להגיב בכאב על מות האפיפיור. נשיא ארה"ב, ג'ורג' בוש, אמר: "הכנסייה הקתולית איבדה את הרועה שלה, העולם איבד את אלוף השמירה על חופש בני האדם ומשרתו הנאמן של אלוהים נקרא לשוב לביתו".
ביקור היסטורי בשנת 2000 הגיע האפיפיור לביקור היסטורי בישראל ובשטחי הרשות הפלשתינית. במהלך ביקורו נפגש עם הרבנים הראשיים, נשיא המדינה וראש הממשלה, ביקר ב'יד ושם' והטמין פתק בכותל המערבי בו כתב: "אנו מביעים צער עמוק על התנהגותם של אלה שבמהלך ההיסטוריה גרמו לבניך היהודים סבל ומבקשים את סליחתך. בכך אנו מביעים את רצוננו להיות אחי אמת לבני בריתו של אברהם".
אחד מיורשיו האפשריים של האפיפיור, הקרדינל כריסטוף שונבורן, המשמש כעת כארכיבישוף של וינה, ביקר בימים האחרונים בישראל ודיבר במילים חמות על זכותם של היהודים על ארץ הקודש. הקרדינל דחה את הטענה הנשמעת ברחבי העולם, לפיה התמיכה האירופית בישראל נובעת מרגשי אשמה בשל השואה.