בארה"ב ובקרב משפחות הנרצחים בפיגועי הטרור ב-11 בספטמבר 2001, גובר החשש כי סוכנות הביון המרכזית האמריקנית, ה-FBI, מנסה לטשטש את מחדליה הגדולים.
זכריה מוסאווי, הנאשם היחיד העומד לדין בארה"ב בשל מעורבות בפיגועים בהם נרצחו כ-3,000 בני אדם, הודה בפעם הראשונה (ו', 23.4.05) במעורבות בתיכנון פיגוע בבית הלבן, אך הכחיש מעורבות בפיגועים בבנייני התאומים ובפנטגון.
הודאתו של מוסאווי מנעה משפט ציבורי בפרשה, וכעת יעמוד בפני חבר מושבעים שידון בגזר הדין בלבד. משפחות הנרצחים הביעו אכזבה מכך שנמנע משפט ציבורי שאמור היה לשפוך אור על פרטי חקירת פיגועי הטרור.
כזכור, סוכני FBI בדרג נמוך התריעו חודשים אחדים לפני הפיגועים הגדולים בהיסטוריה, כי מוסאווי, אזרח צרפתי ממוצא מרוקני, שילם 6,800 דולר במזומן כדי ללמוד להטיס מטוס גדול.
סוכנת FBI בשם קולין רואלי הזהירה כבר בחודש מאי 2001 מפני פעולותיו של מוסאווי, אולם הדרג הבכיר יותר בסוכנות הביון המרכזית לא לקח את האזהרות ברצינות. מוסאווי נעצר לבסוף בחודש אוגוסט 2001 אך שוחרר לאחר זמן קצר.
רק לאחר הפיגועים נעצר מוסאווי שוב, מאז הכחיש כל מעורבות. עורכי דינו של מוסאווי טוענים פומבית כי ניסו לשכנע את מרשם לא להודות בפרשה, אולם הכינו עבורו תצהיר בו הודה בששה סעיפי אישום. על חלקם עשוי להיגזר עליו גזר דין מוות.
בתצהיר מספר מוסאווי כי התאמן במחנה אימונים של אל-קאעידה באפגניסטן. כמו כן, ניהל בית הארחה של הארגון בקנדהר, דבר המעיד על כך שנהנה מיוקרה רבה בקרב הטרוריסטים. לאחר מכן נפגש עם אוסאמה בן לאדן (אותו הוא מכנה: "אבי הג'יהאד), אשר העניק לו את ברכתו האישית לקראת המבצע. "זכור את חלומך", אמר לו מנהיג אל-קאעידה.
מוסאווי יצא לארה"ב ושם החל בלימודי טיסה. יחד עם שאר חבריו לקנוניה קנה מספריים וסכינים קטנות מספיק כדי שלא יתגלו בידי בודקי הביטחון בשדות התעופה. בביצוע הפיגועים לא השתתף, אולי בשל החשש שהוא נמצא במעקב.
ראשי התביעה הכללית בארה"ב כינסו אמש (ו') מסיבת עיתונאים מיוחדת בה הביעו סיפוק רב מהודאתו של מוסאווי: "העובדה שהשתתף בקנוניה הטרוריסטית הזאת אינה מוטלת עוד בספק", מסרו בסיפוק.