פעילי ימין ניסו (יום ד', 13.7.05) לחסום את הכניסות לירושלים ואת צומת גהה, אולם המשטרה הצליחה למנוע מהם לרדת לכביש ולהתיישב עליו. במקביל הניחו פעילי ימין מטעני דמה בצומת נורדיה ובצומת סגולה וגרמו לחסימת הצירים לכחצי שעה.
על-פי המשטרה, עשרות פעילי ימין בירושלים עיכבו את התנועה למשך מספר דקות באיזור גינות סחרוב, בצומת שורש ובפינת הרחובות בר-אילן ושמואל הנביא. המשטרה עיכבה לחקירה מפגין אחד שסירב להתפנות.
עשרות פעילי ימין הפגינו גם באיזור צומת גלילות ובצומת מורשה. כוחות משטרה גדולים היו ערוכים במקום. נמסר כי לא היתה הפרעה לתנועה והמפגינים עמדו בצידי הדרך. המשטרה הקימה תצפיות גם לאורך כביש איילון כדי למנוע את חסימות כבישים. בצומת גהה ניסו כחמישים מפגינים לחסום את התנועה אך נהדפו על כוח משטרה שהמתין במקום. המפגינים עברו לצידי הכביש והתנועה זרמה. חמישה מפגינים, בתחילת שנות העשרים לחייהם, נעצרו ונכלאו.
המשטרה הנחתה (יום ד', 13.7.05) כבר בצהריים את כל יחידותיה להתכונן לאפשרות שפעילי ימין ינסו היום אחר-הצהריים לחסום כבישים ברחבי הארץ, בעקבות הודעת רה"מ אריאל שרון, על איסור כניסה לרצועת עזה למי שלא מתגורר במקום.
כל יחידות המשטרה בארץ קיבלו הנחיה לתגבר את התחנות. ניידות סיור יחלו לנוע בכבישים כהערכות לקראת החסימות הצפויות. ארגון הבית הלאומי הודיע, כי מעתה ייחסמו הכבישים לתנועה על-ידי הפעילים שלו כל יום שני ורביעי. בכוננות כעת נוטלים חלק גם יחידות המסוקים של המשטרה, יחידות הפרשים וניידות משטרת התנועה הארצית.
בעקבות המידע שהתקבל במשטרה על כוונה לחסום כבישים יצאו חוקרי מפלג התשאול ביחידה המרכזית של משטרת ירושלים וערכו חיפוש במשרדי ארגון "הבית הלאומי" בעיר. השוטרים החרימו כונני מחשב וחומר החשוד כהסתה. לדברי המשטרה נמצא גם מסמך ובו הוראות למפקדי הצמתים האמורים להיחסם. צעירה בת 18 שלטענת המשטרה יש חשד כי היא משמשת כ"מתאמת חסימות הכבישים" עוכבה לחקירה.
בעקבות הודעת ראש הממשלה על הוצאת צו איסור כניסה לרצועה ולצפון השומרון הורה פיקוד המשטרה ליחידות הכחולות וגם לפלוגות מג"ב להתפרס בצירי קו התפר המובילים לצפון השומרון ולרצועה.
מפקד המחוז הדרומי במשטרה, ניצב אורי בר לב, מסר כי שוטרי המחוז הדרומי פרוסים בשטח. מאות שוטרים הקימו מחסומים ומבצעים סיורים מסביב לרצועת עזה שהוגדר כעת שטח "מעגל 5" (שטח הבטחה לקראת משימת תכונית ההינתקות).
"השוטרים מאיישים מחסומים ביחד עם חיילים ומסיירים בציר. מטרת המחסומים הינה מניעת כניסת אזרחים שאינם מתגוררים ברצועת עזה להכנס לשטחה ולפעול לסיכול ביצוע המשימה או לשבשה. השוטרים תודרכו להיות סובלניים אשר למעבר תושבים תוך דגש על שמירה של שגרת החיים", מסר ניצב בר בלב.
עומסי תנועה בצומת כיסופים בצומת כיסופים נרשמו עומסי תנועה כבדים, שכן מאות מתנחלים ומתנגדי ההינתקות הגיעו לאזור, חלקם באוטובוסים מאורגנים מתוך כוונה להכנס לרצועה. פעילי הימין התעמתו עם שוטרי מג"ב, קראו לעברם קריאות גנאי וניסו לשכנעם להפר פקודה. לא בוצעו מעצרים. בערב חסמו למעלה מ-50 כלי רכב את המחסום ואת ציר הגישה לתוך גוש קטיף. המתנחלים סרבו להציג את תעודות הזהות ומחאו על סגירת הרצועה.
מוקדם יותר בצהריים חילץ כוח משטרה בסיוע חיילים, את מנכ"ל משרד הביטחון, עמוס ירון, שסייר ביישוב כפר דרום. נמסר שירון הגיע לשוחח עם תושבים אך התקבל בעויינות והיה חשש לניסיון לפגוע בו.
השר לביטחון פנים, גדעון עזרא, שחתם על הצו לסגירת רצועת עזה וצפון השומרון, אמר היום בין היתר כי "היינו רוצים שלא תהיה המולה גדולה של אנשים רבים שרוצים להיכנס, על-מנת שנוכל לבצע את הפינוי בעדינות הראויה. ככל שיהיה צורך לפנות יותר אנשים, זה רק יקשה עליהם ועל הכוחות. על-פי הערכות במערכת הביטחון, ישנם כ-1,000 אנשים בתוך הגוש שאינם מורשים להיות שם אך בשלב הזה לא יהיה ניסיון לפנותם אלא בדרך של פניה אישית ובקשה מהם לעזוב את המקום".
בצומת נורדיה בשרון חסמה המשטרה את הצומת לתנועה למשך כחצי שעה לאחר שהתגלה במקום חפץ חשוד. בדיקה של החבלן העלתה כי מדובר בתיק ובו חוטי חשמל ופתק בו נכתב: "ההינתקות תתפוצץ לכם בפנים".
בית משפט השלום בבאר-שבע שיחרר את פעיל הימין נעם לבנת, אחיה של שרת החינוך, שנעצר אמש עקב הפרת צו מצידו וכניסה לרצועה בניגוד לצו אלוף הפיקוד. לבנת שוחרר בתנאים מגבילים. לבנת ביקש מבית המשפט לשוב לגוש על-מנת להתארגן אך בית המשפט התנגד.
בשעות הערב נחסם צומת סגולה בפ"ת בעקבות חפץ חשוד. בדיקת חבלן משטרתי העלתה כי מדובר במטען דמה שהורכב מחוטים בתוך תיק וצורף אליו הפתק הרגיל: "ההינתקות תתפוצץ לכם בפנים".