מי שעמד בראש התקפות הטרור שב-11 בספטמבר 2001 זוהה על-ידי ארה"ב יותר משנה לפני ההתקפות, כך טוען גורם במודיעין, סקוט פילפוט. לדבריו, מוחמד עטא זוהה כחבר בארגון אל-קעאידה ב-2000, אך בפנטגון אמרו כי לא נמצאו מספיק עדויות מפלילות באותו הזמן.
את הדברים אמר פילפוט בראיון לחדשות פוקס. דבריו דומים לאלה אשר נאמרו על-ידי פוליטיקאים וגורמים בצבא. לדבריו, מוחמד עטא זוהה כחבר באל-קעאידה בתחילת 2000 על-ידי אנשי הצוות בתוכנית הסודית 'Able Danger', יחידת מודיעין אשר איתרה חברים בארגון אל-קעאידה.
עטא נחשב כמוח המתכנן מאחורי פיגועי התאומים. הוועדה אשר חוקרת את התקפות הטרור ב-11 בספטמבר 2001 בארה"ב טוענת בעצמה,
בדברים שפרסמה בתחילת החודש, כי גורמים במודיעין האמריקני זיהו, מבעוד מועד, את מוחמד עטא ושלושה חוטפים נוספים אשר ככל הנראה היו חלק מתא של אל-קעאידה, כבר למעלה משנה לפני הפיגועים. ואולם, למרות זאת, הם לא העבירו את המידע לרשויות החוק.
מחדלי ה-FBI אין זו הפעם הראשונה שה-FBI מצטייר כמי שלוקח חלק מרכזי במחדלי ה-11 בספטמבר - בחודש אפריל השנה הודה זכריה מוסאווי, הנאשם היחיד שהועמד לדין בארה"ב בשל מעורבותו בפיגועים, במעורבות בתכנון פיגוע בבית הלבן.
כזכור, סוכני FBI בדרג נמוך התריעו חודשים אחדים לפני הפיגועים הגדולים בהיסטוריה, כי מוסאווי, אזרח צרפתי ממוצא מרוקני, שילם 6,800 דולר במזומן כדי ללמוד להטיס מטוס גדול.
סוכנת FBI בשם קולין רואלי הזהירה כבר בחודש מאי 2001 מפני פעולותיו של מוסאווי, אולם הדרג הבכיר יותר בסוכנות הביון המרכזית לא לקח את האזהרות ברצינות. מוסאווי נעצר לבסוף בחודש אוגוסט 2001 אך שוחרר לאחר זמן קצר. רק לאחר הפיגועים נעצר מוסאווי שוב, מאז הכחיש כל מעורבות.
המעקב אחר עטא הופסק מוחמד עטא אלסיד נולד ב-1968 בכפר "אל-שיח" במצרים, החזיק בידו אזרחות סעודית וחי בעיר הבירה המצרית קהיר. במשך תקופת לימודיו לא ניהל עטא אורך חיים דתי אך לאחר שהשלימם עבר לגרמניה שם התחיל בהשפעת חברו ללמוד איסלם והשתתף בהטפות נגד התנהלות המערב במזרח התיכון; בעזרת אותו חבר קיבל עטא את הדרכון הסעודי שלו. בשנת 1995 ביקר במכה במסגרת ההתחזקות הדתית.