במהלך ישיבת מטכ"ל שהתקיימה הבוקר (ב', 10.10.05) הודיע הרמטכ"ל, רב-אלוף דן חלוץ, כי הרב הצבאי הראשי, תא"ל ישראל וייס, יפרוש מתפקידו בקרוב.
בתגובה כינס הרב וייס את יועציו והודיע על כוונתו לפרוש מתפקידו בתחילת 2006. אולם בשעות הצהריים הודיע דובר צה"ל, כי הרמטכ"ל לא הורה לרב וייס לפרוש מהתפקיד, אלא סוכם כי יסיים את כהונתו במהלך השנה השישית לכהונה, כלומר עד קיץ 2006.
המטה העולמי להצלת העם והארץ, המזוהה עם הפלג המשיחי בחב"ד, מביע סיפוק מהפרישה וכותב בהודעה חריפה מטעמו: "ידיו של וייס טבולות בדם יהודים ושיתוף פעולה נגד עם-ישראל".
העתירה נגד הרב וייס תימשך הרקע לדברי הרמטכ"ל הינו עתירה שהוגשה ביום חמישי האחרון (6.9.05) לבית המשפט העליון על-ידי קרן לה"ב (לחיזוק היהדות בצה"ל) נגד המשך כהונתו של הרב הצבאי הראשי, תא"ל ישראל וייס.
בעתירה נכתב, כי הרב הצבאי הראשי החל לכהן בתפקידו לפני כשש שנים, וזאת למרות שבסיכום עימו נכתב ששירותו כרב צבאי ראשי לא יארך מעל ארבע שנים.
בית המשפט לא נענה לבקשת העותרים להוציא צו על תנאי שימנע מהרב בצבאי להיות שותף במינויים חדשים ברבנות הצבאית. בית המשפט הודיע אתמול לעו"ד קולנגי, המטפל בעתירה, כי בכוונתו לדון בעתירה בהרכב עד ה-30 לינואר, ועל צה"ל יהיה למסור תשובה בנידון שבעה ימים קודם למועד הדיון.
מהפרקליטות הצבאית הראשית נמסר כי העתירה התקבלה אך הם טרם התפנו לעסוק בה, אולם כעת, משהודיע על כוונתו לפרוש, בכוונת קרן לה"ב למשוך את העתירה אם הדברים יאושררו בכתב. "מטרתנו אינה לנגח את הרב וייס", אמר ל-Nfc יו"ר הקרן, הרב פנחס איזק, "אלא לעמוד על כללי מינהל תקין גם ברבנות הצבאית".
הרב ישראל וייס הינו הרב הצבאי הראשי הרביעי. קדמו לו בתפקיד הרבנים שלמה גורן, מרדכי פירון וגד נבון.
הרבנות תחדל להתקיים כגוף עצמאי בתוך כך חושף הבוקר אתר האינטרנט של עיתון הצופה כוונה במערכת הצבאית להפסיק את תיפקודה של הרבנות הצבאית הראשית כגוף עצמאי בצה"ל ולהכפיפה תחת חסותו של ראש אכ"א. מצה"ל טרם נמסרה תגובה לידיעה. מלשכת ראש אכ"א העדיפו לשמור על חשאיות ובחרו שלא להגיב לפירסום.