בג"צ קבע (22.12.05) כי העתירה שהגישה המועצה האזורית רמת הנגב נגד המדינה, בנוגע לטיפול במפגעי רמת חובב, היתה מוצדקת וכי על המדינה לשלם הוצאות משפט חלקיות בסך 20,000 ש"ח בגין הצורך שבהגשתה, ובגין התנהלות המדינה.
ביוני 2004 עתרה המועצה האזורית רמת הנגב, באמצעות משרד עו"ד אליעד שרגא ושו"ת, נגד שר הבריאות דני נווה, מ"מ השר לאיכות הסביבה מודי זנדברג, היועץ המשפטי לממשלה מני מזוז והמועצה המקומית תעשייתית רמת חובב, בדרישה לפרסם את הדוח האפידימיולוגי ולהגיש תוכנית חירום לטיפול במפגעי רמת חובב.
כעבור חודש ובעקבות העתירה, פורסם הדוח ובג"צ הורה למדינה להכין בתוך 90 יום תוכנית חירום לטיפול במפגעי רמת חובב, דבר אשר ייתר את המשך הדיון בעתירה.
בין הצדדים התפתחה מחלוקת בעניין הוצאות המשפט, כאשר המדינה טענה כי מדובר היה בעתירה מיותרת, ואילו המועצה טענה, כי המדינה נקטה בסחבת ולא עמדה במועדים שנקב בית המשפט, דבר שגרם לה נזקים רבים.
רשם בית המשפט, יגאל מרזל, דחה את טענות המדינה וקבע כי "הגשת העתירה הביאה, למצער, לזירוז הטיפול בעניין" ומוסיף כי נראה שהגשת העתירה היא שהביאה לפרסום הסקר בעת שבה פורסם.
עוד דוחה מרזל את טענת המדינה לפיה העתירה היתה מיותרת ומציין, כי "עם התקדמות הדיונים בעתירה התקדם הטיפול בבעיה".
לפיכך, כאמור, החליט הרשם לפסוק הוצאות בסך 20,000 ש"ח בגין הצורך בהגשת העתירה ובגין התנהלות המשיבים.
במועצה האזורית רמת הנגב הביעו שביעות רצון לנוכח החלטת בית המשפט: "המסקנה היא כי גם אם טחנות הצדק טוחנות לאט אסור לוותר" אומר ראש המועצה האזורית שמואל ריפמן. "עתירת המועצה האזורית רמת נגב שגם בג"צ פסק כי היתה במקומה, הביאה להחלטת הממשלה על תוכנית חירום ולהקמת צוות בין משרדי בראשות המנכ"ל שעוקב אחר התקדמות השיפורים הנדרשים"
עם זאת מוסיף ריפמן "אסור לנוח על זרי הדפנה וצריך להמשיך ולדרוש מהמפעלים והמשרד לאיכות הסביבה לפעול להורדת הזיהומים באופן מוחלט".
