מעט לאחר השעה 21:30 נשמע פיצוץ (ג', 21.2.06) בסמוך למעבר קרני בצפון רצועת עזה. כוחות רבים הגיעו למקום והחלו לסרוק את השטח ובמקביל המעבר נסגר לתנועה.
לא דווח על נפגעים וההערכה העיקרית היא שמדובר במנהרה שנחפרה על-ידי פלשתינים באזור המעבר והתפוצצה. מספר חיילים דיווחו כי חשו את האדמה רועדת, מה שמחזק את ההשערה.
מעבר קרני משמש למעבר סחורות מישראל לרצועה ולהפך. בחודשים האחרונים היו מספר התרעות על כוונת אירגוני הטרור לבצע פיגועים במקום. המעבר נסגר לתקופה בת חודשיים ובתחילת החודש (5.2.05) נפתח המעבר מחדש. בעבר כבר היו מספר פיגועים במקום בהם נהרגו מספר ישראלים, בינהם גם אזרחים שעבדו במקום.
במערכת הביטחון כבר כמה חודשים קיימות התרעות על כוונת הארגונים לפגע במקום. אחד המתווים ממנו חוששים הוא חפירת מנהרת תופת תחת המעבר ופיצוצו במטרה להביא לקריסת חלק מהמעבר. גורמי צבא העריכו הלילה, כי ייתכן והפיצוץ התרחש במנהרה שכזו כתוצאה מ"תאונת עבודה" במהלך הכנות לפיגוע.
היסטוריה של פיגועים וסיכולים ב- 13.1.05 נרצחו
שישה אזרחים ישראלים בפיגוע משולב שאירע במסוף. ארבעה מההרוגים הם עובדי רשות שדות התעופה ושניים הם נהגי משאיות ישראלים. גדודי חללי אל-אקצה של הפת"ח, גדודי עז א-דין אל-קסאם של החמאס וחטיבות נאסר סלאח א-דין של ועדות ההתנגדות העממית, נטלו אחריות לפיגוע.
ב- 22.1.06
ביצע חיל האוויר ירי לעבר שלושה חמושים פלשתינים אשר התקרבו לגדר הסמוכה למעבר קרני. ביום 14.12.05
חוסלו מהאוויר ארבעה פלשתינים אשר נסעו ברכב לעבר מעבר קרני. במערכת הביטחון סיפרו, כי מדובר בפעולת חיסול מהאוויר נגד מספר מחבלים מארגון "ועדות ההתנגדות העממית" שהיו בדרכם לביצוע פיגוע באמצעות מכונית תופת במחסום קרני.
לדברי גורמי צבא, הפיצוץ שהתרחש היה חזק מאוד בשל חומרי נפץ רבים שהיו ברכב. בעקבות ניסיון הפיגוע הוחלט לסגור את מעבר קרני עד להודעה חדשה.
