ממלא-מקום ראש הממשלה, אהוד אולמרט, פתח הבוקר (א', 5.3.06) את ישיבת הממשלה שעיקר דיוניה נסוב סביב האירועים בכנסיית הבשורה בנצרת בסוף השבוע. אולמרט פתח את דבריו באומרו, כי יש לנהוג באיפוק ואחריות ולא להפוך את התקרית בנצרת לתקרית על-רקע דתי. "מדובר באירוע מצער שנבע מנסיבות אישיות", אמר והוסיף, כי הוא שמח שהוא הסתיים כמו שהוא הסתיים.
אולמרט מתח ביקורת על הפיכת האירוע לאירוע על-רקע דתי ואף ביקר את המנהיגות המוסלמית במדינה באומרו, כי "יש כאן ניסיון ליצור רווחים פוליטיים ממשהו כמעט מגוחך".
"דווקא הציבור המוסלמי, שאינו מצטיין בגילויי סבלנות כלפי הנצרות... הם שצועדים בראש המחאה, בשל תקרית שנגרמה על-ידי זוג תמהונים, וזאת רק בשביל למנף אינטרסים פוליטיים בתקופה זו?!", אמר אולמרט.
"במהלך האירוע שוחחתי עם השר לביטחון פנים, מפכ"ל המשטרה, ראש עיריית נצרת, ראשי הכנסיות והפטריארך הלטיני. שרת החוץ קיימה מגע עם הוותיקן, כל זאת בניסיון להסביר את הרקע של המקרה ואת נסיבותיו האישיות, הפרטיות, שאין להם שום קשר לנושאים אחרים, ואת המאמץ שאנו עושים להביא לסיומו המהיר והרגוע", הוסיף.
ולמרות ההדגשה כי אין קשר דתי-לאומני לאירוע, אמר אולמרט גם ש"לא ניתן לאיש לפגוע בחופש הדת והפולחן שימשיך להיות בישראל כדוגמה לכל מדינות העולם".
"מדינת ישראל, במשך שנים מאז קיומה, מקפידה על חופש הפולחן והדת ועל קיום סובלנות מלאה כלפי מוסדות הדת של כל הדתות הפעילות במדינה. זו אמונתנו, זו דרכנו, כך נהגנו, כך אנו נוהגים וכך נמשיך לנהוג".
ראש עיריית נצרת: ראש עיריית נצרת, ראמז גראיסי, מסר בתגובה לדברי מ"מ ראש הממשלה, אהוד אולמרט: "הצהרות אלה הן ניסיון אומלל לתקוע טריז בין בני העם האחד ומשקף מדיניות הממשלות השונות בישראל, שמסרבות לראות בנו מיעוט לאומי ומתייחסות אלינו כאוסף של עדות שונות".
ח"כ אחמד טיבי מסר בתגובה לדברי אולמרט: "אמירה תמוהה של מי שרוצה לראות אותנו עדות נפרדות ולא מיעוט לאומי אזרחי. יש מי שרוצה להמשיך להפריד בין מוסלמים, נוצרים ודרוזים על-מנת שמשימתו להחלשת המיעוט הערבי תהיה קלה יותר. אני גאה שהמוסלמים הגנו על כנסיית הבשורה ואני בטוח שערבים נוצרים לא יהססו להגן על המסגדים".
עמיר פרץ: גם אם מדובר במשפחה של מטורפים צריך לנהוג בהם בחומרה יו"ר מפלגת העבודה, ח"כ עמיר פרץ, נפגש הבוקר בנצרת עם הפטריארך סבאח וארכיבישוף מרקוצו ואמר: "המזה"ת הוא אחד האזוים המורכבים ביותר. יש בו מתחים רבים וכל גפרור יכול להצית בעירה גדולה. גם אם מדובר במשפחה של מטורפים צריך לנהוג בהם בחומרה כדי להעביר מסר לכל מטורף שלא יעז לבטא את הטירוף שלו במקום קדוש, אחרת נרוץ משריפה לשריפה ויבוא יום ולא נגיע בזמן.
לא ניתן לקיצוניים לנצל את הדתות ולהפוך אותן לחרב מהתפכת. פגיעה במקומות הקדושים היא חרב פיפיות, היום היא מופנת לצד אחד ומחר לצד השני".
השרה ציפי לבני סקרה את ביקורה באירופה השרה ציפי לבני, התייחסה בישיבת הממשלה לביקורה באירופה וציינה כי במהלך הביקור נדונה השפעת עליית החמאס ברשות והצורך לעמוד על תנאי הסף שנקבעו ולמצוא במקביל פתרונות הומניטריים להעברת כספים שלא דרך החמאס והרשות החמאסית העתידית.
כמו כן הועלה הצורך להבטיח את המשך העמידה האירופאית על עקרונות הטיפול בסוגיית הגרעין האירני. עוד העלתה השרה את סוגיית האנטישמיות וסיפרה כי ביקרה בבית משפחת חלימי וציינה כי כל הגורמים עימם נפגשה השמיעו מסר של נחישות לטפל בתופעה. סוגיה נוספת אותה העלתה השרה היא הצורך בהכנסת החיזבאללה לרשימת ארגוני הטרור האירופאית.