המגעים הקואליציוניים שמוביל החמאס בניסיון לגבש ממשלה רחבה עלו על שרטון לאור המחלוקת המתמשכת עם תנועת הפת"ח, על קווי היסוד המדיניים של ממשלת החמאס. החמאס נחוש להציג ממשלה בראשותו כבר בשבוע הקרוב גם ללא שותפות של הפת"ח, אם זו לא תשנה את עמדותיה.
תנועת החמאס השעתה את המשך המגעים הקואליציוניים על מעצר מנהיג החזית העממית אמש (ג', 14.3.06) בגלל פעולת צה"ל ביריחו. קודם לכן העבירה החמאס לכל המפלגות הפלשתיניות את הנוסח המתוקן של מצע הממשלה הפלשתינית בו ניסתה החמאס לשלב את הערות המפלגות לנוסח המקורי. בפת"ח עדיין סבורים שגם הנוסח המתוקן אינו כולל שינויים מהותיים ואינו עונה על דרישות הבסיס של הפת"ח, שכן הוא מתעלם מחוק היסוד של הרשות הפלשתינית, מהצהרת העצמאות של אש"ף מ-1988, התוכנית המדינית של אש"ף ומההסכמים שנחתמו עם ישראל.
לא דורשים הכרה בישראל מנהיג הפת"ח בפרלמנט, עזאם אלאחמד, טען, כי המחלוקת עם החמאס אינה עוסקת בשאלת ההכרה בישראל, שכן לדבריו הפת"ח לא תבקש לעולם מהחמאס להכיר בישראל. בפת"ח הביעו מורת רוח רבה על כך שהחמאס בחרה להמשיך המפגשים הדו צדדיים עם המפלגות במקום לכנס את כל הגושים הפרלמנטאריים לישיבה משותפת לון במצע הממשלה.
גורמים בחמאס ציינו דווקא בנימה אופטימית, כי במגעים הקואליציוניים הושגה התקדמות רבה והסכמה בנקודות הבאות: התנגדות לצעדים חד-צדדיים של ממשלת ישראל, ארגון מחדש של אש"ף, תוכנית הרפורמה הפנימית במישור החברתי והכלכלי. עם זאת, הם הדגישו, כי החמאס לא תסכים לעולם לקבל את הצהרת העצמאות הפלשתינית כמקור סמכות מדינית משום התמיכה בה בפתרון שתי מדינות בפלשתין וההכרה המשתמעת בזכות קיומה של מדינת ישראל.