היום בשעה 11:00 נשמעה ברחבי הארץ צפירת דומייה בת שתי דקות, דגלי המדינה הורדו לחצי התורן, וישראל מתייחדת עם זכרם של חללי צה"ל וקורבנות פעולות הטרור. ב-43 בתי עלמין צבאיים ברחבי הארץ ובאנדרטה לחללי צה"ל הבדואים בצומת המוביל מתקיימים טקסים ממלכתיים.
בהר הרצל נפתחה מייד לאחר הצפירה העצרת המרכזית. ב- 13:00 בצהריים נפתח במקום,
הטקס המרכזי לנרצחי פעולות האיבה במעמד נשיא המדינה, משה קצב, ראש הממשלה (בפועל), אהוד אולמרט, שרים חברי כנסת, ומשפחות הנרצחים.
אולמרט: רב ועצום החוב שמדינת ישראל חבה לחלליה במהלך נאומו בטקס אמר אולמרט: "בלב כולנו, כלל אזרחי ישראל, טמונה ההכרה הכואבת במחיר החרות, הביטחון וההגנה על הבית ועל כל הטוב והיקר שיצרנו ובנינו כאן". הוא המשיך ואמר, כי "רב ועצום הוא החוב שמדינת ישראל חבה לחלליה. בדמם נקנתה תקומתה, בנפשם הם גוננו עליה מכל צר ואויב. בזכותם היא חזקה ומשגשגת והישגיה מפליגים ומפליאים. על כן בערב חג עצמאותה היא מתייחדת עם גיבוריה, דואבת על אובדנם, ומכירה להם תודה עד בלי די".
לקראת יום העצמאות החמישים ושמונה למדינת ישראל נרחיק היום מתוכנו כל ריב ומחלוקת", אמר אולמרט וציין: "נזכור כי הנופלים שהבטיחו לנו ריבונות ודרור רעים היו לנשק, אחים להקרבה ולאהבת מולדת; ללא הבדל השקפה ועדה, בני עיר ובני כפר, ערי פיתוח, התנחלויות, קיבוצים ומושבים, שכונות מצוקה ופרברי יוקרה. יהודים, דרוזים, מוסלמים ונוצרים. יחדיו כאיש אחד. לכולם יאה תהילה".
ליבני: לא באתי לכאן לנחם, כי אין נחמה שרת החוץ, ציפי ליבני, אמרה בבית העלמין הצבאי בנחלת יצחק כי "לא באתי לכאן לנחם, כי אין נחמה. הזמן שעובר אינו משכך את הכאב, הוא רק מעצים את הגעגוע, לו יכל עם ישראל, היה לוקח את כאבם של משפחות השכול ומחלקם במשותף בין כולם. אבל בשכול אין שיוויון".
הנשיא קצב בכותל: בזכות דם הנופלים נחתמו הסכמי השלום יום הזיכרון לחללי מערכות ישראל ולנפגעי פעולות האיבה מצוין החל מאמש (ב', 1.5.06). בשעה 20:00 בדיוק נשמעה צפירת דומייה בת דקה בכל רחבי הארץ לזכר הנופלים במערכות ישראל.
לאחר הצפירה החל הטקס המרכזי בכותל המערבי. בטקס השתתפו נשיא המדינה, הרמטכ"ל ונציגי המשפחות השכולות. במרכזי הערים ובבית יד לבנים מתקיימות עצרות זיכרון.
בטקס בכותל אמר נשיא המדינה, משה קצב: "כאן במקום הקדוש ביותר לעם היהודי אנחנו מתייחדים עם חללי מערכות ישראל. אין עוד מקום המספר בתמצית את קורות העם היהודי". הוא המשיך וציין, כי "בזכות דם הנופלים נחתמו הסכמי השלום עם מצרים וירדן". "בזכות הנופלים קמה מדינת ישראל", הדגיש הנשיא.
"מיום ששבנו לארצנו מחדש אנחנו נאלצים להגן על בתינו מפני אוייב ומתנכל... אנחנו לא עם שוחר מלחמות. תאוות הנקם זרה היא לרוח ישראל", אמר הנשיא קצב. "ביום הזה אין מחלוקת ביננו. כולנו משפחה אחת. הבה נוכיח כי אנו ראויים לנופלים", המשיך ואמר.
הרמטכ"ל, רב-אלוף דן חלוץ, אמר בנאומו, כי "תקומת העם היהודי יקרה מאוד. הזכות לעמוד כאן ולזכור הוענקה לנו על-ידי רענו אשר נפלו". לדבריו, יש להמשיך את העשיה בכל יום ויום. "אל הארץ הזו ולכותל זה נשאנו תפילה אלפיים שנות גלות".
"אל לנו לקבל את עצמאותנו כדבר המובן מאליו. אלה החפצים ברעתנו לא פשו מעולם וכל המתריס על זכותנו לגור בארץ מזכיר לנו שאנו אחראים לגורלנו. אחדותנו כעת כעם חיונית לבצר את עמדתנו", אמר הרמטכ"ל והוסיף, כי "הלחימה בטרור גם השנה גבתה מחיר. הנופלים השנה מצטרפים לרשימה ארוכה של נופלים".
מספר הנופלים במערכות ישראל משנת 1860, שנת תר"ך, ועד ליום 26.4.06 עומד על 22,123 מקום המדינה נהרגו במערכות 20,535 חללים. מקום המדינה נהרגו בפעולות טרור ואיבה 1,597 בני אדם. מאז יום הזיכרון האחרון ועד ליום 26.4.06 נוספו למניין הנופלים 138 חללים, מספר זה כולל נכי צה"ל שנפטרו עקב נכותם.
זוכרים, שרים ומספרים בבנייני האומה בירושלים התקיים בשעה 20:30 ערב זיכרון. הערב מיועד לציבור דתי ומבוגר שאינו מתחבר לאירוע בכיכר בתל אביב. דב קלמנוביץ, היוזם של ערב זה אמר, כי רבים מהציבור הדתי ומבוגרים מגיעים לאירוע בירושלים, ואשתקד השתתפו בו 3,000 איש.
בכיכר רבין בתל אביב התקיים האירוע השנתי - שרים בכיכר. יאיר לפיד ינחה את הטקס אשר ישתתפו בו זמרים וזמרות.
השנה, זו השנה השלישית, מתקיים גם טקס בחלקת חללי הטרור בחיפה, במקביל לשאר טקסי יום הזיכרון בבתי העלמין הצבאים. בטקס ייצג את המדינה נציג הכנסת ח"כ משה כחלון, סגנית ראש העיר פרופ' עליזה שנהר, נציגי עיריית חיפה, רבנים ואישי ציבור.
בבית העלמין בחיפה הוקמה בזמנו חלקה נפרדת אשר בה נקברו חללי הטרור של הפיגועים של השנים האחרונות. בניגוד לערים אחרות אשר בהם מפוזרים קברי חללי הטרור בכל בית העלמין, בחיפה כל הקברים מרוכזים בחלקה אחת.