בית הדין הצבאי בשומרון דחה (א', 2.7.06) את הקראת כתב האישום נגד מזכ"ל החזית העממית, אחמד סעדאת, זאת לאחר שסעדאת הוצא מאולם בית המשפט עקב סירובו להזדהות עם פתיחת הדיון. בפרקליטות ציינו, כי עקב מידע חדש נשקלת האפשרות לשנות כמה סעיפי אישום בכתב האישום שכבר הוגש.
לפני כחודש וחצי, הוגש לבית הדין הצבאי בשומרון כתב אישום נגד סעדאת. מזכ"ל החזית העממית נעצר במהלך פשיטת כוחות צה"ל על בית הסוהר ביריחו לפני כשלושה חודשים, פשיטה שנערכה עקב עזיבת הפקחים הבריטיים והאמריקנים את המקום.
במהלך הפשיטה, נעצרו מלבד סעדאת גם פואד שובאכי - איש הכספים של עראפת שהיה אחראי בין היתר על הבאת האוניה קארין A וכן נעצרו רוצחיו של השר רחבעם (גנדי) זאבי.
סעדאת (53) תושב אל-בירה שליד רמאללה, הואשם ב-19 אישומים שונים, ביניהם: קשירת קשר לגרימת מוות בכוונה, סחר בציוד מלחמתי והסתה, חברות ופעילות בהתאחדות בלתי מותרת, נשיאת משרה בהתאחדות בלתי מותרת.
בכתב האישום נטען, כי משנת 1995 ועד שנת 2006 בה נעצר, פעל סעדאת כחבר בארגון החזית העממית לשחרור פלשתין. במסגרת תפקידו היה אחראי על פעילות הארגון באזור רמאללה וכן על הפעילות הצבאית של החזית העממית. סעדאת, היה אחראי על תכנון שורת פיגועים ובין היתר בשנת 1999 התכוונו אנשי ארגונו להניח מטען חבלה בבית קפה "רימון" בירושלים ולפוצצו במקום.
בא-כוחו של סעדאת, עו"ד מוחמד חסן, מסר למחרת הפשיטה כי מרשו מכחיש כל קשר לרצח השר זאבי. בנוסף, אמר סעאדת לחוקריו כי הוא אינו מכיר בחקירה וכי כל שהותו במתקני הכלא הישראלים היא בלתי-חוקית.
את הקו הנוכחי, ניסה סעדאת להמשיך עם פתיחת משפטו בבית הדין הצבאי בשומרון. הבוקר, אמור היה להתקיים שלב הקראת כתב האישום נגד סעדאת, אולם סעדאת סירב לעמוד על רגליו ולהזדהות. הוא הוצא בכוח מהאולם ובהסכמת התביעה וההגנה נדחתה הקראת כתב האישום לחודש ספטמבר.