בעימותים במאחז עמונה דווח על עשרות נפגעים בקרב המתנגדים, ביניהם גם חברי כנסת. גם עשרות שוטרים נפגעו מלבנים, אבנים ובקבוקים שהושלכו לעברם. חברי הכנסת אפי איתם ואריה אלדד מהאיחוד הלאומי נפצעו ופונו מהמקום. צה"ל הזניק למקום מסוקי חילות כדי לסייע בפינוי הנפגעים הרבים. לפחות 219 איש, שוטרים ומפגינים נפגעו בעימותים.
בסיום האירוע דיווחו במד"א ובמשטרה כי 219 שוטרים, חיילים ומפגינים נפצעו. אחד נפצע קשה, תשע בינוני והיתר קל. כאשר סיימו הכוחות את פעולתם והחלו לצאת מהיישוב נדקר שוטר מג"ב על-ידי צעיר. השוטר נדקר באמצעות דוקרן מאולתר ומצבו מוגדר כקל עד בינוני.
מרכז מידע לגבי פצועים בעמונה בטלפון: 02-9974999.
ח"כ אפי איתם נפגע בראשו מפגיעת אבן, גם ח"כ אריה אלדד נפגע נקע את ידו. הם פונו מהמקום לתאג"ד לקבלת טיפול רפואי ובהמשך איתם הועבר לבית החולים. לדבריו של ח"כ איתם, הוא נפגע מפרש משטרתי. על-פי דווח של גורם משטרתי נראה, כי איתם נפגע בראשו מאבן שהושלכה על-ידי אחד המתנחלים.
חבר הכנסת אפי איתם העובר לבית החולים הדסה עין כרם בירושלים. הוא הוכנס ליחידת הטראומה בבית החולים כשהוא סובל מסחרחורות ונעזר במסכת חמצן.
שני שוטרים נפצעו באורח קשה שני שוטרי מג"ב מפונים במסוק מעמונה לבית החולים בירושלים. מצבם מוגדר קשה. אחד מהם מוגדר קשה מאוד. על-פי דווח ראשוני שוטר אחד עבר תקיפה מצד עשרות צעירים שהמשיכו להכותו כאשר נפל על הרצפה. השני סובל מחבלה קשה בראשו ככל הנראה מאבן שהושלכה עליו. סה"כ נפצעו יותר מ- 80 שוטרים, כאשר רובם במצב קל.
עשרות נפגעים בעימותים מהשטח נמסר, כי לפחות 150 מתנגדים נפצעו עד כה בעימותים בין שוטרים למתנחלים בישוב עמונה. חלקם מקבלים טיפול בשטח. רובם במצב קל, אך כמה במצב בינוני. לדברי אנשי יש"ע, שוטרי יס"מ עושים שימוש באלות במהלך עימותים עם בני נוער וצעירים סביב הבתים בעמונה.
ממד"א נמסר, כי הם טיפלו בלפחות 100 נפגעים כאשר חלקם הועברו לבתי החולים. עשרות פצועים רוכזו באוהל עזרה ראשונה מאולתר שהוקם בתחילת שורת הבתים בעמונה. במקום מטופלים הפצועים על מזרונים ובאמצעים מאולתרים, בהם פגועי ראש. מד"א פינה 144 פצועים לבית החולים. לבית החולים שערי צדק בירושלים הובאו 11 פצועים, כולם במצב קל. לבית החולים בלינסון בפתח תקוה הובאו במסוק שלושה פצועים, שוטר ושני אזרחים.
במד"א הקימו במקום תחנת עזרה ראשונה קדמית והם מטפלים בנפגעים, הן השוטרים והן המתנגדים. במקום נמצאים כ-30 אמבולנסים, ניידות נט"ן וכן עשרות חובשים אשר הוזעקו למקום. מסוקי צה"ל אף הם מגיעים למקום כדי לסייע בפינוי. כמו כן הובאו אוטובוסים כדי לפנות את הפצועים מהמקום.