הקיץ הישראלי מביא עמו עלייה בולטת במחלות זיהומיות הפוגעות במעי. זאת בעיקר משום שהחום והלחות מזרזים את התרבות החיידקים במזון שאינו מקורר או במים עומדים. לדוגמה, בסלט שמונח מחוץ למקרר במשך שעה יגדל מספר החיידקים פי מאות ואלפים.
מחלות המעי נגרמות הן מחיידקים והן מנגיפים וטפילים (פרזיטים). מחלות חיידקיות נוטות להסתמן בחום גבוה יותר ובשלשול רירי, לעיתים דמי.
הסכנה העיקרית במחלות הללו היא איבוד נוזלים והפרת מאזן המלחים. ילדים קטנים נתונים בסיכון יתר עקב משקלם הנמוך וחוסר יכולתם לשתות ולהחזיר את האובדן. ההתמודדות הטובה ביותר עם המחלות הללו היא בדרך המניעה: הקפדה על קירור המזון והימנעות מצריכת מזון שלא אוחסן כהלכה, הקפדה על רחיצת פירות וירקות. מאחר שחלק מהזיהומים מידבקים יש להקפיד על בידוד (לא לשלוח את הילד לגן או לבית הספר) ועל רחיצת ידיים, ויש להימנע מלחלוק כלי אוכל.
הטיפול אבן היסוד בטיפול היא השבת הנוזלים לגוף במגוון צורות - שתיית מיצים, מרק וכדומה. מוטב שלא להסתמך על מים צלולים בלבד, מכיוון שתכולת המלחים והסוכרים בהם אינה מספקת. קיימים בשוק תכשירים המכונים "oral rehydration solutions", המכילים מלחים וסוכרים שכמותם מדויקת ואשר שווים מבחינת ערכם למתן עירוי דרך הווריד.
חסרונם הוא בטעמם שלא תמיד ערב לחִכּם של ילדים. סימנים המעידים על התייבשות כוללים אדישות (אפתיה), ירידה בתפוקת השתן, בכי ללא דמעות ויובש בפה. בתינוקות קטנים ניתן לחוש שקיעה של המרפס הקדמי. אם מופיעים סימני התייבשות או הילד אינו מסוגל לשתות עקב הקאות או חוסר רצון, יש לפנות מיד לרופא בשל הצורך בטיפול בעירוי תוך-ורידי, לפחות עד שהילד יהיה מסוגל שוב לשתות.
שלא כבעבר, אין צורך למנוע מהחולה בדלקת מעי חדה כל סוג של מזון, ובכלל זה מוצרי חלב, פירות וירקות. טיפול בתרופות לעצירת השלשול אינו מומלץ והוא עלול להגביר את סיבוכי המחלה בגלל הישארות ממושכת יותר של החיידק המזהם ותוצריו בחלל המעי.
טיפול בתרופות נוגדות הקאה (כגון פראמין) אינו מומלץ עקב השפעות לוואי על מערכת העצבים המרכזית. בדרך כלל ניתן להתגבר על ההקאות במתן נוזלים בכמויות קטנות (20-10 מ"ל) לעיתים קרובות.
ברוב המקרים אין צורך בטיפול באנטיביוטיקה והמחלה חולפת מאליה.
במקרים מסוימים כמו זיהום בחיידק הסלמונלה, טיפול אנטיביוטי אף עלול להאריך את משך הפרשת החיידק בצואה. טיפול אנטיביוטי שמור למצבי מחלה קשים במיוחד - חום גבוה, שלשול דמי או מוגלתי, מצב המכונה דיזנטריה. מקרים אלו נגרמים לרוב מחיידק השיגלה.