החל מ-29 במרס תחל החברה לשווק את טיסותיה לתקופת האביב והקיץ. בשיא העונה, החל מ-21 ביוני, תפעיל אל על 246 טיסות שבועיות לכ-40 יעדים. בין היתר ייצאו 22 טיסות שבועיות לניו יורק, שמונה טיסות לבנגקוק, חמש טיסות ללוס אנג'לס ולהונג קונג, 19 טיסות לפריז, ארבע טיסות לקהיר והחל מה-2 במאי שלוש טיסות שבועיות לדרום אמריקה בקו החדש: תל אביב-סאו פאולו. מדובר בגידול של כ-20% בתדירויות לעומת עונת הסתיו והחורף.
חיים רומנו, מנכ"ל אל על: "גם בעונת הקיץ הקרובה, לצד השקת הקו הישר החדש לסאו פאולו, ממשיכה אל על לתת דגש מיוחד על המשך הצמיחה ביעדים ארוכי הטווח - צפון אמריקה והמזרח הרחוק, ושיפור היצע התדירויות וזמני היציאה בכל שאר היעדים. אל על מציעה לנוסעיה העסקיים ולנופשים, את לוח הטיסות האטרקטיבי ביותר, באמצעות הוספת יעדים, הוספת תדירויות ומבצעים. לוח הטיסות אביב קיץ - 2009, שם דגש מיוחד על יעדי הצמיחה של אל על ועל מתן מענה לצרכים של הלקוחות העיסקיים של החברה, המהווים את אחד ממנועי הצמיחה העיקריים".
דרום אמריקה סאו פאולו - ב-2 במאי 2009 משיקה אל על את הקו הישיר לסאו פאולו ותפעיל שלוש טיסות שבועיות ליעד במטוסים מדגם 777.
צפון אמריקה לוס אנג'לס - לאור ההצלחה והביקוש - אל על מגדילה את היצע המושבים בטיסות הישירות ללוס אנג'לס. לאורך כל חודשי הקיץ, מוסיפה אל על טיסה שבועית ותפעיל חמש טיסות לילה שבועיות ישירות בטיסה LY005 ללוס אנג'לס בימים ראשון עד חמישי.
ניו יורק - באביב 2009 מגדילה אל על את היצע המושבים והתדירויות לניו יורק ותפעיל 22 תדירויות, אל מול 17 באביב ובסתיו.
טורונטו - באביב 2009 מציעה אל על שלוש תדירויות שבועיות. בשיא הקיץ מוסיפה טיסה שבועית ומציעה ארבע תדירויות שבועיות.
המזרח הרחוק ואפריקה הונג קונג - אל על תפעיל בעונת הקיץ חמש טיסות שבועיות להונג קונג. הונג קונג הוא יעד עסקי בכל ימות השנה ויעד תיירות פופולרי למשפחות במיוחד בחודשי הקיץ.
בנגקוק - במהלך אביב-קיץ 2009 תפעיל אל על שמונה טיסות שבועיות בשיא הקיץ.
בומביי - אל על תפעיל במהלך הקיץ שלוש טיסות שבועיות ישירות, בלו"ז המותאם לצרכי הנוסע העסקי.
בייג'ין - אל על תפעיל במהלך הקיץ שלוש טיסות שבועיות ישירות, בלו"ז המותאם לצרכי הנוסע העסקי.
יוהנסבורג - בקיץ 2009 תפעיל אל על שלוש טיסות שבועיות. אל על התאימה את טיסותיה לנוסע העסקי ומציעה יציאה בימי ראשון וחזרה בימי חמישי.
מערב אירופה לונדון - שתי טיסות יומיות להית'רו במטוסים מדגם 777 או ג'מבו וטיסה שבועית לסטנסטד במטוס 767. בשיא הקיץ מוסיפה אל על עוד שתי טיסות שבועיות לסטנסטד.
פריז - אל על תפעיל 19-16 טיסות שבועיות במהלך הקיץ.
מרסיי - הוספת טיסה חמישית בשיא הקיץ. עליה של 25% בתדירויות ובהיצע המושבים.
אמסטרדם - אל על תפעיל בקיץ 2009 טיסה יומית כפולה, למעט ביום ג'. סך-הכל 10 טיסות שבועיות.
בריסל - טיסה דו-יומית בימים א', ב', ד', סך-הכל תשע תדירויות, לעומת שש תדירויות בעונת החורף.
מדריד - שתי טיסות יומיות. סך-הכל 11 תדירויות שבועיות.
רומא - שתי טיסות יומיות. סך-הכל 11 תדירויות שבועיות.
מילאנו - שתי טיסות יומיות. סך-הכל 11 תדירויות שבועיות.
ברצלונה - שש תדירויות שבועיות.
ציריך - שתי טיסות יומיות. סך-הכל 12 תדירויות שבועיות.
ג'נבה - שלוש טיסות שבועיות. תגבור טיסה רביעית בשיא הקיץ.
ברלין - הוספת שתי תדירויות. סך-הכל בקיץ, חמש תדירויות שבועיות.
פרנקפורט - הוספת טיסה ביום ה' בבוקר. סך-הכל שמונה טיסות שבועיות.
מינכן - חמש תדירויות שבועיות.
וינה - חמש תדירויות שבועיות.
מזרח אירופה בודפשט - שש תדירויות שבועיות.
פראג - חמש תדירויות שבועיות.
ורשה - הוספת טיסה חמישית, כמענה לתנועה העיסקית.
בוקרשט - על-מנת להיענות לביקושים הן מחו"ל והן בישראל בעונת הקיץ ולהמשיך לתת מענה לתנועה העסקית, מוסיפה אל על טיסה שבועית ומציעה 10 טיסות שבועיות בעונת הקיץ.
סופיה - שלוש תדירויות שבועיות.
מוסקבה - 11 טיסות שבועיות. הפעלת שתי טיסות שבועיות במטוסי 777, בימים ראשון ושישי.
קייב - שש תדירויות שבועיות. תגבור טיסה שביעית בשיא הקיץ.
לנינגרד - שלוש טיסות שבועיות החל משיא הקיץ.
דייטנופטרובסק - הכפלה של הטיסות בקיץ, מטיסה שבועית לשתי טיסות, שיצאו בימים ד' ובמוצ"ש.
אודסה - טיסה שבועית אחת.
טיסות אזוריות אתונה - הוספת טיסה שבועית. סך-הכל חמש טיסות שבועיות. שידרוג לטיסת בוקר מתל אביב.
קהיר - בקיץ 2009 מכפילה אל על את מספר הטיסות לקהיר מ-2 ל-4, כמענה לביקושים הגוברים לחבילות לתיירות נכנסת.