התנועה למען איכות השלטון בישראל עתרה לבג"צ (יום ב', 10.6.02) נגד שר הפנים, אלי ישי, בשל חלוקת כספים בניגוד לכללי מנהל תקין.
העתירה הוגשה באמצעות עוה"ד שרגא אליעד, ברק כלב וצרויה מידד. היא עוסקת בחלוקת מענקים לרשויות מקומיות על-ידי השר מתוך "קופת השר" - המשמשת לחלוקת מענקים בסכומים של מיליוני שקלים. בעתירה נטען כי חולקו כספים מבלי לבדוק קריטריונים לזכאות למענק, היעדר הליך בדיקה ובלי איסוף מידע והתייעצות עם גרומי הביקורת במשרד הפנים בטרם הענקת המענק.
כך קרה ששר הפנים העניק לפני מספר חודשים מיליון ש"ח מ"קופת השר" למועצה אזורית חבל מודיעין בראשות דוד טוביאנה, למרות קיומם של מסמכים המצויים בידי משרד הפנים המעידים על התנהלות לקויה של המועצה. בנוסף, קיימת הודעה של גורמי הביקורת במשרד הפנים על עצירת מענק בסכום דומה עקב פגיעה בתוכנית ההבראה מצד המועצה, הגדלת הגירעון במיליוני שקלים, וחריגה קשה מניהול תקים וניהול כספי לקוי של ראש המועצה.
התנועה טוענת עוד בעתירה, כי הימנעות השר מקביעת קריטריונים אשר יבטיחו את ענייניות החלטותיו להענקת מענקים, והימנעות מקביעת נוהל לאיסוף מידע ובדיקה טרם הענקת המענקים, עומדת בניגוד לעקרונות המשפט המנהלי כפי שנקבעו בפסיקות בג"צ.
התנועה מבקשת שיוצאו צווים על תנאי, שיורו לשר הפנים לנמק מדוע לא קבע את הקריטריונים, ונהלים בדבר הליך איסוף מידע או התייעצות עם גורמי הביקורת על הרשויות המקומיות טרם חלוקת כספי הציבור.
כמו כן מבקשת המועצה להוציא צו על תנאי, המורה לשר הפנים לנמק מדוע לא ינקטו צעדים כנגד האחראים למתן המענק למועצה אזורית מודיעין, חרף העובדה שלא היתה זכאית למענק. כמו כן, בחינת הליכים משפטיים נגד שר הפנים להשבת הכספים.
בנוסף מבקשת התנועה להוציא צו ביניים נוסף, אשר יורה לשר הפנים להימנע עד לבירור העתירה, מהענקת מענקים נוספים מ"קופת שר הפנים" או ממקור תקציבי אחר המשמש אותו להענקת מענקים לרשויות המקומיות.