מבצע שמיים כחולים נמשך בשעות אחר-הצהריים (ה', 5.1.06) המשיך צה"ל בירי תותחים לעבר מטרות ויעדים באזור צפון רצועת עזה. כשעה לאחר-מכן דווח על שיגור רקטת קסאם לעבר שטח ישראל. הרקטה נחתה בשטחים פתוחים דרומית לזיקים. לא דווח על נפגעים או על נזק.
8 מבוקשים נעצרו ביהודה ושומרון במהלך הלילה עצרו כוחות צה"ל 8 מבוקשים ברחבי אזור יהודה ושומרון. בדיר אל-עצון, מצפון-מזרח לטול-כרם, נעצרו שלושה פעילי ג´יהאד איסלאמי. במחנה הפליטים ג´נין, נעצר פעיל החזית העממית. דרומה לבית-לחם, נעצרו שני פעילי חמאס. בא-קבליה, מצפון-מערב לרמאללה נעצר פעיל חמאס ובאל-בירה, סמוך לעיר רמאללה נעצר מבוקש אחר.
גם בלילה הקודם נמשכו תקיפות התותחים ומהאוויר בעקבות המשך ירי התלול מסלול (רקטות קסאם ופצצות מרגמה - ע.ש) לעבר שטח מדינת ישראל, ואירועי הטרור המתמשכים מרצועת עזה, המשיך צה"ל במהלך הלילה ושעות הבוקר (ה', 5.1.05) בירי ארטילרי מתמשך של פגזים לעבר מרחבי השיגור, וכמו-כן תקף מהאוויר שני צירי גישה בצפון רצועת עזה.
בצה"ל אומרים כי מטרת הפגיעות היא להקשות על תנועת המחבלים למרחבי שיגור ירי תלול מסלול, ולשבש את הניסיונות החוזרים והנשנים של ארגוני הטרור לירות לעבר שטח ישראל ולפגוע באזרחים.
הבוקר והלילה לא שוגרו רקטות קסאם, אך אמש נחתו לפחות שש רקטות קסאם בשטח ישראל, חלק מהן שוגרו לעבר העיר שדרות ואחרות שוגרו לעבר מעבר ארז וקיבוץ זיקים, צפונה לרצועת עזה, באזור שבו פועל צה"ל במסגרת מבצע שמיים כחולים.