בעלי מינימרקטים ומכולות עתרו לבג"צ (יום ב', 19.11.01) נגד השר לאיכות הסביבה וועדת הכלכלה של הכנסת, בדרישה לבטל סעיפים שונים בחוק הפיקדון על מכלי משקה.
העותרים המיוצגים על-ידי עורכי הדין איתן ארז ושלי בגליבטר. הם טוענים כי החוק הפך אותם לעבריינים בעל כורחם, מכיוון שהוא מחייב לשלם כסף מזומן לאספני בקבוקים שכלל לא נרכשו אצלם.
החוק החדש מחייב אותם להחזיק מחסנים מיוחדים, לנהל הנהלת חשבונות מסובכת, להוביל אלפי בקבוקים ולשלם כסף מזומן לאנשים שכלל לא רכשו אצלם את הבקבוקים, ולהפסיד כסף שעה שהם משלמים %17 מע"מ על כל מיכל משקה שיעבירו לתאגיד המיחזור, ליצרן או ליבואן.
כמו כן, טוענים העותרים כי קיימת בעייתיות ביישום החוק לאור אי התאמתו להוראות ניהול ספרים של מס הכנסה, עובדה שמאלצת את בעלי בתי העסק לסטות מההוראות הקיימות בעל כורחם.
העותרים טוענים כי תיווצר פגיעה קשה במיוחד במינימרקטים ובמכולות המצויים ליד ריכוזי מסעדות או מזבלות אזוריות מכיוון שאלפי הבקבוקים שנאספים במקומות אלה מידי יום, יובאו אליהם.
לטענת העותרים אין להם התנגדות להחזיר פיקדונות ללקוחותיהם שרכשו בקבוקים אצלם, אך אם תוטל עליהם חובה לשלם כספים בגין אלפי בקבוקים שיובאו על-ידי אספני בקבוקים, יאלצו להפסיק ולמכור בקבוקי משקה לחלוטין, אילוץ אשר יפגע קשה בחופש העיסוק שלהם, ויחזק עוד יותר את כוחן המונופוליסטי של רשתות השיווק הגדולות.
כמו כן, קיימת טענה כי החוק לא חל על בקבוקי חלב ומוצריו ובקבוקים גדולים מעל 1.5 ליטר. הדבר גורם לכך שהחוק חל רק על חלק קטן מאוד ממיכלי המשקה המשוכלים לאשפה.