משרד ראש הממשלה הודיע (יום א', 28.8.05), כי הגיע להסכמות עם כל המשפחות השכולות שעתרו לבג"צ בעניין העתקת קברי יקיריהן מבית העלמין בגוש קטיף. בעקבות כך החליטו המשפחות השכולות למחוק את עתירתן והדיון בבית המשפט שהיה אמור להתקיים היום (יום ב') התבטל.
ב-22.5.05 עתרו 17 משפחות שיקיריהם קבורים בבית העלמין בגוש קטיף, לבג"צ בנושא העברת בית הקברות הנמצא בגוש קטיף. הם ביקשו מבית המשפט להורות לנציגי המדינה להסביר מדוע לא יבוטל סעיף 144(ב) לחוק ליישום תוכנית ההינתקות המקנה למדינה רשות לפתוח קברי חללי צה"ל, נפגעי פעולות איבה ואזרחי מדינת ישראל, הקבורים בבית העלמין בנווה דקלים ולטפל בקבורה מחודשת שלהם מבלי להזדקק להסכמת משפחות הנפטרים וקבלת רשותם לכך.
בנוסף, הם ביקשו כי המדינה תפנה למשפחות השכולות בטרם תבצע פעולות הקשורות בפינוי הקברים ותמתין להחלטת המשפחות על מקום מגוריהם החדש.
בהודעת משרד ראש הממשלה נאמר, כי במסגרת ההסכמה שהושגה, תהליך העברת הנפטרים מגוש קטיף למקומות קבורה חלופיים נעשה תוך כדי תיאום מלא עם המשפחות, ולעניין זה: זמני ההלוויות, סדרי ההלוויה, שירותים לוגיסטיים ומקום קבורה.
הנושאים ההלכתיים הכרוכים בהעתקת הקברים נידונו עם הרבניים הראשיים לישראל והרב הצבאי הראשי אשר לבקשת משרד ראש הממשלה הוציאו פסק הלכה לפיו יש להעביר את כל הקברים מבית העלמין בגוש קטיף בכפוף לתנאי ביצוע מסוימים.
בחודשים האחרונים הכינה הממשלה מקומות קבורה חלופיים בהתאם לבקשות משפחות הנפטרים. במסגרת זו הוכשרה חלקת קבורה בהר הזיתים המיועדת ל-25 נפטרים, וכמו כן הוכשרה חלקת קבורה חדשה ביישוב מבקיעים המיועדת לקלוט 6 נפטרים מגוש קטיף.
בנוסף, ביישוב ניצן הוקם בית עלמין חדש, כאשר בבתי העלמין בערים: ירושלים, ראשון לציון, נתניה, אשקלון, רעננה ושדרות נערכו כל הסידורים הנדרשים לקליטת הנפטרים שמשפחותיהם ביקשו להעבירם אליהם.
במסגרת עבודת ההכנה להעברת הנפטרים נציגי משרד ראש הממשלה נפגשו עם נציגי המשפחות השכולות, ליוו אותם לאתר הקבורה החלופי, ורק לאחר שבקשותיהם נענו סוכם על העברת הקבר. בנוסף, מנהלת סל"ע הקצתה אנשי רווחה מקצועיים לשם ליווי המשפחות השכולות לאורך כל תהליך העתקת הקברים ובתקופה שלאחר מכן.
במהלך יום א' הועתקו שני קברים והנפטרים הובאו לקבורה מחדש בבתי העלמין בניצן ובשדרות. במהלך יום ב' יימשכו פעולות העברת הקברים ונפטרים וצפויות להתקיים שמונה קבורות מחדש של נפטרים שנטמנו בבית העלמין שבנווה דקלים.