בצה"ל הוחלט להוציא את החיילים המוצבים בתוך ההתנחלות יצהר, ולהותיר רק את ההגנה המרחבית ואת סיורים העוברים במקום, ללא שהיית קבע של החיילים במקום. ההחלטה התקבלה בעקבות שורה של מעשי פגיעה בחיילי צה"ל ובכלי הרכב הצבאיים.
במהלך הלילה נוקבו גלגליו של רכב צבאי. אתמול אחר-הצהריים נוקבו גלגליו של ג'יפ צבאי נוסף. בצה"ל מציינים, כי כלי הרכב משמשים לאבטחת היישוב ולהגנה על תושביו. בהודעת צה"ל נאמר עוד, כי "צה"ל רואה בחומרה ומגנה כל פגיעה ברכוש צה"ל ומוקיע כל ביטוי של אלימות פיזית או מילולית כלפי חייליו וקציניו".
כמו כן, אמש התקיפו עשרה צעירים כמה חיילי צה"ל המוצבים ביישוב. הצעירים היו רעולי פנים, היכו חייל, דחפו אותו לריצפה ולקחו רכוש צבאי אשר מאוחר יותר הושב למקום.
צה"ל מציב באופן קבוע, כמו ביישובים נוספים, חיילים בשער היישוב וכן במקומות נוספים. מדובר בחיילים אשר מובאים למקום במסגרת תורנות אבט"ש - אבטחת יישובים. בעבר ישבה ביישוב פלוגת חי"ר קבועה, אך היא הוצאה מהמקום בעקבות התנכלויות קודמות.
יצהר נחשבת להתנחלות בה מתרחשים מקרים רבים של תקיפת חיילים. אירועים של פגיעה בחיילים מסוג נוסף התרחשו במקום במהלך תקופת ההינתקות. באחד המקרים השחיתו תושבי המקום מערכת טכנולוגית שהוצבה ביישוב על-ידי צה"ל, כדי לסייע בהגנתו. בתקרית אחרת ניתקו התושבים את זרם המים למגורי החיילים ומנעו את חידוש הזרם זמן רב.