במהלך ראש השנה יחולו שינויים בלוח הזמנים של הרכבות.
ביום ב' 3.10.05 - ערב ראש השנה תשס"ו - תפעול הרכבת במתכונת יום ו', בתוספת 6 רכבות מיוחדות בקווים לבאר שבע חיפה ועכו.
ביום ג' 4.10.05 - א' ראש השנה - אין תנועת רכבות.
ביום ד' 5.10.05 - מוצאי חג ראש השנה - תפעול הרכבות במתכונת מוצ"ש, בתוספת רכבת מיוחדת בקו חיפה - תל אביב.