הכרזתו של שר הביטחון, עמיר פרץ, על הקמת ועדה לתפקוד צה"ל בראשותו של אמנון ליפקין שחק, שר ורמטכ"ל לשעבר, לא מתקבלת במערכת הפוליטית בשיויון נפש. גורמים בכירים הביעו הערב (ד', 16.8.06) תמיהות כיצד יכול מי שיעץ לשר הביטחון, לעמוד בראש ועדת חקירה שתחקור מהלכים עליהם יעץ.
כך יו"ר סיעת הליכוד, ח"כ גדעון סער שאמר כי "שר הביטחון קבע שיש צורך בחקירה, אבל שר הביטחון המעורב כל כולו בנושא, אינו רשאי לקבוע את מסגרת החקירה, היקפה והרכב הגוף החוקר. בעיקר, אין הוא יכול לצמצם את החקירה לצה"ל בלבד ולהוציא את הדרג הפוליטי מחוץ לתחום החקירה ואף לקבוע את הרכב הוועדה".
לדבריו, "יו"ר הוועדה, השר לשעבר אמנון ליפקין שחק, השתתף, לפי פרסומים בתקשורת, בפורום התייעצויות שקיים שר הביטחון עצמו בזמן המלחמה. מהלכו של פרץ מצביע על הצורך בהקדמת ועדת חקירה ממלכתית שאת הרכבה יקבע נשיא בית המשפט העליון כגורם בלתי תלוי ולפי סמכותו בחוק ועדות החקירה".
ח"כ שטייניץ: הוועדה פגומה משני טעמים חבר נוסף בסיעת הליכוד, ח"כ יובל שטייניץ טוען כי זהו תרגיל טקטי יפה אבל לא יותר מזה. "ועדת חקירה רצינית צריכה להיות חיצונית למערכת ולצה"ל ולדרג המדיני משום שהוועדה צריכה לחקור גם את שר הביטחון הנוכחי וגם את והקודם".
לדבריו, הוועדה הזו פגומה משני טעמים. "שר הביטחון מינה את הוועדה. איך תחקור את שר הביטחון? גם אם תשמע אותם, איזו צורה תהיה לוועדה? איך תחקור את הממשק בין הדרג המדיני והצבאי?"
בנוסף, אומר ח"כ שטייניץ כי "הוועדה מורכבת מהברנז'ה הצבאית. אני לא נגד אבל כאשר בוועדה ארבעה, חמישה אנשי צבא, הברנז'ה הצבאית של אתמול חוקרת את הברנז'ה הצבאית של היום".
יו"ר סיעת המפד"ל, ח"כ אורי אריאל התייחס גם הוא לוועדת הבדיקה ואמר כי "הוועדה של פרץ היא בריחה מאחריות ויריקה בפרצוף הלוחמים. הציבור בכלל והחיילים שלחמו בפרט דורשים חקירה אמיתית שתכלול את הדרג המדיני ובכללו את ראש הממשלה ושר הביטחון. הוועדה הנוכחית לא תעשה זאת".
ח"כ יתום: להקים ועדת חקירה חיצונית מהצד השני של המפה הפוליטית אמר הערב יו"ר מרצ-יחד, ח"כ יוסי ביילין, ששום ניסיון של עמיר פרץ להקים ועדה פנימית לא יתקבל כתחליף לוועדת חקירה ממלכתית שתבחן את ההיבטים המדיניים, הצבאיים והחברתיים של מלחמת לבנון השנייה. אמנון ליפקין שחק הוא מינוי מצוין כחבר בוועדת חקירה ממלכתית שתקום לאחר שהממשלה תעשה את כל השמיניות באוויר כדי למנוע אותה".
יו"ר הסיעה, ח"כ זהבה גלאון, טענה כי "לא יתכן שהשר שהוא בין האחראים למחדלים הביטחוניים הקשים בזמן המלחמה, הוא זה שממנה ועדה שאמורה לחקור גם אותו". לדבריה, "הקמת הוועדה היא ניסיון לסיכול ממוקד להקמת ועדת חקירה ממלכתית שצריכה לחקור גם את הדרג הצבאי וגם את הדרג המדיני".
ואילו ח"כ דני יתום (עבודה) מברך על הקמת ועדת החקירה אך יחד עם זאת קורא להקמת ועדת חקירה חיצונית שאינה תלויה ברשות המבצעת. קרי, לכל הפחות ועדת חקירה פרלמנטרית.