משטרת גרמניה עצרה בסוף השבוע את החשוד כ"מוח" שתכנן את הפיגועים בשתי רכבות ב- 31 ביולי בגרמניה. החשוד, פאדי א.ס, אזרח סורי בן 23, נעצר בעיר קובלנץ. החוקרים טענו, כי את הוראות ההכנה לפצצות מצא ברשת האינטרנט. כך מדווחת סוכנות הידיעות AP (א', 27.8.06).
עוד דווח כי הרשויות בגרמניה ובלבנון עצרו שני חשודים נוספים, לבנונים במוצאם, יוסף מוחמד וג'יהאד חמאד אשר חשודים כי בנו פצצות על-פי ההוראות שמצא עבורם פאדי. זה האחרון חשוד גם כי עזר להם לברוח ללבנון דרך טורקיה וסוריה, שעות ספורות לאחר שנכשל הפיגוע. הפיגוע כשל, לאחר שראשי הנפץ נותקו ממקומם אך כשלו בהצתת מיכלי הגז.
בשלב זה לא הואשמו עדיין החשודים. התביעה אמרה כי הם נחקרים בחשד להיותם חלק מקבוצת טרור, בניסיון רצח ובסעיפים נוספים. מקור בכיר במערכת המשפט בלבנון אמר כי הרשויות בביירות עצרו חשוד רביעי, לבנוני בן 24.
גורמים בגרמניה אמרו, כי המעצר התאפשר גם בזכות מצלמות המעקב בתחנת הרכבת בקלן, אשר קלטו את השניים גוררים את שתי המזוודות בהן הטומנו הפצצות. בעקבות זאת שוקלת משטרת גרמניה להוסיף מצלמות מעקב במקומות רגישים, בין יתר האמצעים הנוספים.