בראיון שהעניק לשבועון האמריקני "טיים", (ו', 8.09.06) הכריז נשיא אירן לשעבר, מוחמד חתאמי, כי הוא מכיר בשואה כעובדה היסטורית. "אני מאמין שהשואה היא פשע של הנאצים". עם זאת, הוסיף כי "אסור שהשואה תשמש, בכל צורה שהיא, תירוץ לדיכוי זכויות הפלשתינים". חתאמי חזר על תמיכתו בעיקרון "שתי מדינות לשני עמים": הקמת מדינה פלשתינית לצד מדינת ישראל.
אמירה מפתיעה נוספת של חתאמי - העושה בביקור בן שבועיים בארה"ב - קשורה לפיגועי ה-11 בספטמבר: "ב-11 בספטמבר בוצעו למעשה שני פשעים: - אחד הם הוא הרג אלפי חפים מפשע; השני, העובדה שהפיגועים בוצעו בשם האיסלאם". הוא הוסיף, כי מאז הפיגועים, מתמודדים מוסלמים תושבים ארה"ב, עם תופעת ה"איסלמופוביה". פיגועי ה-11 בספטמבר, יצרו בארה"ב שינאה כלפי מוסלמים ופחד מפניהם.
במהלך אירוע של המועצה האמריקנית-איסלאמית, לציון מלאת חמש שנים לפיגועי ה-11 בספטמבר, פנה חתאמי (יום שישי) לקהל: "אתם חייבים להוכיח ליתר אזרחי ארה"ב, כי הדיבורים בתקשורת על האיסלאם בתקשורת, אינם נכונים". "אתם צריכים להיאבק ב'איסלמופוביה' ובשנאה כלפי האיסלאם, נגדה אנו מתמודדים כעת".
לדבריו, עומדות בפני המוסלמים שלוש מטרות: "האחריות שלכם, בראש ובראשונה, היא להיות אזרחים טובים בכל מדינה בה אתם נמצאים. עליכם לנסות להתקדם בסולם החברתי והחינוכי - עבורכם ועבור ילדיכם. לבסוף, עליכם להיאבק בשנאה כלפי האיסלאם, שנוצרה בגלל אנשים ... שמטרתם להרוג אנשים, אלה הם טרוריסטים חסרי מוסר, שלא יזכו להגיע לגן העדן. פעולות כאלו בשם האיסלאם הן שקר".
