"הממשלה הפלשתינית עומדת על זכות העם הפלשתיני לפעול ולהיאבק על-מנת לשחרר את אדמותיו וכך לסיים את הכיבוש, בכל השיטות והדרכים הלגיטימיות". כך נקבע בקווי היסוד של "מסמך ההסכמה הלאומית" עליו מתבססת ממשלת האחדות הלאומית. קווי היסוד סוכמו על-ידי יו"ר הרשות, אבו מאזן, וראש הממשלה הפלשתיני, איסמעיל הנייה. את הנוסח הכולל את קווי היסוד של ממשלת האחדות הצפויה לקום מסרו לסוכנות הידיעות "מען" מקורות מדיניים פלשתינים.
בקווי היסוד מודגש גם, כי ממשלת האחדות תכבד את ההסכמים שנחתמו עם ישראל: "הממשלה תכבד את ההסכמים אשר נחתמו על-ידי אש"ף". לצד זאת, מצוין כי ממשלת האחדות שתוקם תעזור ליו"ר הרשות, אבו מאזן, בהכנת תוכנית מדינית "להשגת המטרות הלאומיות על בסיס היוזמה הערבית וההחלטות הבינלאומית... מבלי לפגוע בזכויות העם הפלשתיני".
הממשלה, לפי קווי היסוד, תפעל להסיר את המצור בכל דרך אפשרית ולהשיג תמיכה ערבית, איסלאמית ובינלאומית. בנוסף, היא תפעל לשחרר את כל האסירים והעצורים בבתי הכלא הישראלים.
קווי היסוד מדגישים, כי הממשלה עומדת על זכות השיבה: הממשלה "קוראת לקהילה הבינלאומית לקיים את החלטת האו"ם שמספרה 194 בעניין זכות השיבה לפליטים הפלשתינים ופיצויים".
"הקפאת השיחות - זמנית" דובר הממשלה הפלשתינית מסר היום (ב', 18.9.06), כי הקפאת השיחות להרכבת ממשלת האחדות, כפי שפורסם אתמול וכפי שהוצהר על-ידי אבו מאזן, לא תשפיע על הסיכוי להקמתה. לדבריו, "קיים רצון עז של הפלגים הפלשתינים להקים ממשלת אחדות לאומית, וכולם יקבלו את מה שיוחלט על-ידי רה"מ הנייה ואבו מאזן".
דובר הפתח, אחמד עבד אל-רחמן אמר דברים דומים. לדבריו, עצם הקפאת השיחות לא מעיד על הגעתן למבוי סתום. "השיחות תימשכנה לאחר שובו של אבו מאזן מארה"ב", אמר.