בכירים בארגון האומות המאוחדות הביעו (יום ה', 9.11.06) ביקורת חריפה על צה"ל נוכח הרג האוכלוסיה האזרחית הפלשתינית בבית חנון אתמול. מועצת הביטחון של האו"ם קיימה ישיבה מיוחדת במטרה לשמוע את גרסת הצדדים על התקרית המצערת בצפון רצועת עזה.
ריג'אד מנזור, משקיף פלשתיני באו"ם, דרש ממועצת הביטחון להפעיל לחץ על ממשלת ישראל: "כמה פלשתינים צריכים להיהרג כדי שמועצת הביטחון תנקוט במעשה? היה לנו מספיק", אמר. מנזור דרש ממועצת הביטחון לדאוג לכך שישראל תפסיק את הירי הארטילרי לעבר הרצועה. כמו כן, ביקש הנציג הפלשתיני לקדם חקירה נרחבת על התנהלות מבצע "ענני סתיו", וגם להציב משקיפים מטעם האו"ם בשטח הרצועה.
דניאל כרמון, השגריר הישראלי, אמר כי ממשלת ישראל הביעה צער על התקרית, והדגיש כי ההרוגים הם "קרבנות של הטרוריזם של ארגון החמאס". "אם הטרוריסטים הפלשתינים לא היו תוקפים את ישראל ללא הרף, ואם החמאס לא היה משגר רקטות קסאם מעזה לישראל, התקרית בבית חנון לא היתה מתרחשת", אמר כרמון בפני חברי מועצת הביטחון.
שגריר ארצות הברית באו"ם, ג'ון בולטון, אמר כי על הצדדים להכיר בכלל ההסכמים שנחתמו בעבר. "על הממשלה ברשות הפלשתינית מוטלת האחריות לנקוט בכל האמצעים הנדרשים במטרה למנוע את ירי רקטות הקסאם מעזה לישראל", אמר בולטון.
אנג'לה קינג, מזכירת הסוגיות הפוליטיות באו"ם, גינתה את תקיפת צה"ל והדגישה כי 18 ההרוגים היו אזרחים חפים מפשע שלא היו חמושים. "התקרית בבית חנון ביום רביעי היא מזעזעת. גברים, נשים וילדים שבשום אופן לא היוו איום נהרגו במהלך שינתם", אמרה קינג. "על אף כי מדובר בתקרית בעלת מימדים גדולים מהרגיל, אין זו הפעם הראשונה בה מבצע צבאי של ישראל בשטחי הרשות הפלשתינית מסתיים במותם של מספר גדול של אזרחים", הוסיפה.
ארגון הבריאות העולמי ציין כי 82 פלשתינים נהרגו במהלך השבוע הראשון בחודש נובמבר. מתוכם, 21 היו ילדים, 12 נשים, ו-49 גברים. לפי הדיווח הישראלי, 57 מתוך ההרוגים היו "טרוריסטים חמושים".
