עם תחילתו של החורף, עולה החשש מעלייה במספר המקרים של וירוס שפעת העופות הקטלני - H5N1 - בקרב עופות ובני אדם במצרים, כך על-פי דיווחים של גורמי בריאות רשמיים. "במצרים, כמו בשאר העולם, למרות שננקטו כל אמצעי הזהירות, עלולה להתחיל התפרצות חדשה", כך הזהיר סעיד אל-עבסי, גורם רשמי ממשרד הבריאות המצרי במסיבת עיתונאים. הוא הוסיף ואמר כי הסכנה מתחדשת בכל עונה חדשה של נדידת עופות, ומאחר שמצרים היא אחד ממסלולי הנדידה העיקריים, הרי שהיא נפגעת במיוחד. אמש התקיימה פגישה בין גורמים פלשתינים לנציגים ממשרד החקלאות לצורך רענון והדרכה בנושא שפעת העופות ולאור המקרים במצרים. דוברת משרד החקלאות מסרה ל- Nfc, כי אין כרגע כל מצב חירום וכי הפגישה נועדה למטרות רענון בלבד. התפרצות שפעת העופות במצרים, לדבריה, החלה כבר לפני מספר חודשים ואין כרגע כל הדרדרות במצב. ב- 11 בנובמבר הודיע שר הבריאות המצרי כי מיקום חדש של התפרצות שפעת העופות נתגלה בלוקסור, 720 קילומטר דרומית לבירה, קהיר. על-פי דברי שר הבריאות, אזור נאג'ה אל-עבדיה מוחזק בבידוד לאחר שעופות מבוייתים נבדקו ונתגלה כי הן נושאים את הווירוס. עופות באזורים סמוכים נשחטו. לא דווח על מקרי הדבקות חדשים בבני אדם, על-פי דברי אל-עבסי. עד כה רוב המקרים בקרב בני אדם נמצאו קשורים לגידול עופות בבית, שעדיין נפוץ מאוד. שפעת העופות לא עוברת דרך עופות מבושלים. למרות שהוטל איסור על גידול מסוג זה באזורים עירוניים מיד לאחר שהווירוס אובחן לראשונה, גידול בעלי חיים בבית באזורים חקלאיים נשאר נפוץ מאחר שהממשלה האמינה כי הטלת איסור דומה במקומות אלו לא יהיה יעיל. "איסור יביא לכך שאנשים רבים יסתירו את העופות, ויגבירו בכך את הסכנה יותר מאשר ידכאו אותה", אמר עבדל רחמן שאהין, דובר שר הבריאות. במקום זאת, הרשויות ניסו להתמקד בהעלאת המודעות בכל המדינה, כמו גם בהדרכה של עובדי בריאות ועובדי רווחה לגבי הדרך שבה יש לטפל במקרים של שפעת העופות. מבין 15 בני אדם שנדבקו בשפעת העופות מאז חודש מרס 2006, שבעה מתו. מקרה המוות האחרון היה ב- 30 באוקטובר. מאז אובחנה שפעת העופות לראשונה בעופות במצרים - בחודש פברואר השנה, יותר מ- 30 מיליון עופות נשחטו תחת השגחה ממשלתית, רובם בחוות חקלאיות לגידול עופות.