ראש אגף חקירות במודיעין, ניצב יוחנן דנינו, החליט להטיל את חקירת ראש הממשלה על היחידה הארצית לחקירות הונאה בפיקודו של ראש היחידה תנ"צ שלומי איילון. ובתוך כך, עמותת אומ"ץ פנתה הערב (ג', 16.1.07) ליועמ"ש מני מזוז בדרישה שיורה למנוע מראש הממשלה, אהוד אולמרט, ביצוע של שינויים מהותיים בממשל בעת תקופת חקירתו במשטרה.
העמותה דורשת שבתקופה זו לא ימנה אולמרט שרים חדשים, לא יבצע שינויים בתפקודם של שרים אחרים ולא יבצע מינויים של עובדים בכירים אחרים בשירות הממשלתי. במקביל תובעת העמותה ממזוז להתערב בעניין הייצוג הכפול של פרקליט ראש הממשלה, עו"ד אלי זהר, המייצג גם את המפכ"ל משה קארדי בפרשת ועדת זיילר.
בשעתו, פנתה העמותה אל מזוז בנדון ונענתה שכל עוד לא נפתחה חקירת משטרה נגד אולמרט אין ניגוד אינטרסים בייצוג הכפול.