המשרד לאיכות הסביבה טיפל בשנת 2006 בכ-558 תיקים של עברייני איכות הסביבה. מבין תיקים אלו, ב-101 תיקים ניתנו פסקי דין על-ידי בתי המשפט, ירידה של למעלה מ-10 ביחס לשנת 2005 בה הגיעו 115 תיקים לבתי המשפט. אולם סך הקנסות אשר הוטלו על העבריינים עלה בכ-10% והגיע ל-9,213,200 ש"ח לעומת 8,444,260 בשנת 2005.
בשנת 2006 עלה אחוז התיקים אשר הסתיים בהרשעה של המעורבים (בין אם הרשעה מלאה או חלקית). מקרב 101 התיקים אשר הגיעו אל בתי המשפט, 98 תיקים (כ-97%) הסתיימו בהרשעה לעומת 94% בשנת 2005.
הקנס הגבוה ביותר שהוטל בשנת 2006 עמד על 1,600,000 שקלים. בתי זיקוק לנפט חוייבו בקנס זה בשל גרימת זיהום אוויר. מרבית תיקי התביעה עסקו בענייני פסולת (40%), מים ונחלים (22%), וכן בנושאים כגון ים וחופים, שילוט, חומרים מסוכנים והדברה.
רותי רוטנברג, היועצת המשפטית של המשרד להגנת הסביבה, מסרה כי נתונים אלה משקפים את המשך מגמת ההחמרה של בתי המשפט כלפי מזהמי סביבה, הבאים לידי ביטוי לא רק בגובה הקנסות, אלא גם בנכונות להטיל עונשים על נושאי משרה, כגון: מנהלי מפעלים וראשי רשויות, ואף בהטלת עונשי מאסר במקרים של עבירות חוזרות.
הלשכה המשפטית במשרד להגנת הסביבה משלימה הכנות לחקיקת מספר חוקים סביבתיים, ביניהם התיקון לחוק שמירת הניקיון בעניין הטלת היטל הטמנה, חקיקת החוק למחזור צמיגים, תיקון לחוק הפיקדון על בקבוקי משקה, הכנות לחקיקת חוק אוויר נקי, ויישום חוק הקרינה הבלתי מייננת, שנכנס לתוקף בימים אלה ושביצועו מחייב התקנת תקנות.