היחידה הארצית לחקירות הונאה סיימה את חקירתה ב"פרשת אגרקסקו" בנוגע לטיסות חברי הכנסת רוחמה אברהם ואלי אפללו, טיסות שבוצעו במימון חברת "אגרקסקו". על-פי החשד, חברי הכנסת אפללו ואברהם טסו לחו"ל במימון חברת ההובלה החקלאית, כאשר בשגרת עשייתם הפרלמנטארית נדרשים השניים לנושאים הקשורים בפעילות חברת "אגרקסקו" או נושאים המשיקים לתחומי פעילותה של החברה להובלה חקלאית.
מאחר ולאור חומר החקירה שנאסף אצל חוקרי היחידה הארצית לחקירות הונאה, התברר כי מדובר כאן במקרה גבולי וכי אין אפשרות לקבוע באופן חד-משמעי כי אכן שני חברי הכנסת עברו עבירות חד-משמעיות, הוחלט במשטרה להעביר את כל חומר החקירה בפרשה, לבחינת פרקליטות המדינה אשר תאלץ להנחות את המשטרה כיצד יש להמשיך ולנהל את תיק החקירה או לחילופין ינחו על המשך טיפול משפטי כזה או אחר.
כזכור בשנת 2004 נסעו חברי הכנסת רוחמה אברהם ואלי אפללו, שהיו אז סגני שרים בממשלת שרון, לארצות הברית במימון ובאירוח מלא של חברת "אגרקסקו". מבקר המדינה, מיכה לינדנשטראוס, בדק חשד שנסיעה זו מהווה עבירה על כללי האתיקה של הכנסת.
על-פי בדיקת המבקר, פנו חברי הכנסת אברהם ואפללו לוועדת האתיקה וביקשו אישור לנסיעה, במטרה להכיר את פעילותה של חברת אגרקסקו. הוועדה אסרה על הנסיעה, ולמרות זאת, על-פי החשד, נסעו כעבור שנה לארצות הברית והסתירו את העובדה כי החברה היא שמימנה את הנסיעה. בתקופת הנסיעה כיהנו אברהם ואפללו כחברים בוועדת הכספים ולכן נבדק על-ידי המבקר - האם באותה תקופה דנה ועדת הכספים בנושאים כלכליים הנוגעים לחברה. השניים הודיעו לאחר מכן שיחזירו את כספי עלות הנסיעה.
שני חברי הכנסת נחקרו במשרדי היחידה הארצית לחקירות הונאה בבת-ים, כשביום שלישי, 30.01.07, נחקרה ח"כ רוחמה אברהם (קדימה) תחת אזהרה. ח"כ אברהם נחקרה בחשד לשוחד, מרמה והפרת אמונים, ומסרה בחקירתה את גרסתה המלאה בפרשה. אך הכחישה את הכוונות הפליליות שיוחסו לה, ומכל מקום היא טענה בנוסף כי היא כבר נענשה במסגרת הכנסת על-פי הדין המשמעתי. כך גם היה בעניינו של ח"כ אפללו שנחשד אף הוא בשוחד, מרמה והפרת אמונים וטען את אותם הטיעונים שטענה חברתו לנסיעה ולכנסת. גם חבר הכנסת אפללו נחקר תחת אזהרה.
הח"כים החזירו הכספים עלות הסיור שבו השתתפו חברי הכנסת אפללו ואברהם, עלה לחברת "אגרסקו" 6,800 דולר, וההוצאות בעבור שני חברי הכנסת הסתכמו ב-4,388 דולר. אברהם אמרה אז כי "יתכן שנעשתה טעות בתום לב". מאז החזירו שני חברי הכנסת את סכומי הכסף בגובה ההטבות שקיבלו מהחברה.
מבקר המדינה, מיכה לינדנשטראוס, שבדק אז את הפרשה קבע אז כי מנכ"ל חברת "אגרסקו" ציפה לתמורה עבור הנסיעה שארגן לחברי הכנסת, ואף פנה בעניין לחברת הכנסת רוחמה אברהם וביקש ממנה להיעזר בה כדי שתקדם את האינטרס של החברה ובו בין השאר תדאג להחזרת האחריות על ביצוע הבדיקות הביטחוניות למטענים שהחברה מייצאת. כך, קיוו ב "אגרקסקו", תחסוך החברה חלק מהעלויות לאחר שהתקשתה להתמודד עם תחרות בתחום המטענים החקלאיים.
כאמור היום החליטו ביחידה הארצית לחקירות הונאה, להעביר את כל חומר החקירה בפרשה לעיונה של פרקליטות המדינה שתחליט בימים הקרובים על המשך הטיפול החקירתי והמשפטי בפרשה שבה מעורבים שני חברי הכנסת.
