הפרקליט הצבאי הראשי, תא"ל אביחי מנדלבליט, הורה (יום ה', 15.3.07) למשטרה הצבאית החוקרת (מצ"ח) לחקור את הטענות לפיהן עשו כוחות צה"ל שימוש אסור באזרחים, במהלך פעילות שהייתה לפני כשבועיים בעיר שכם. כך נמסר בדובר צה"ל.
ארגון זכויות האדם "בצלם" פרסם (8.3.07) עדויות לפיהן במהלך מבצע "חורף חם" בשכם בסוף חודש פברואר, השתמשו חיילים בשני ילדים פלשתינים, בת 11 ובן 15, וכן בתושב העיר בן 24, כמגינים אנושיים. לדברי "בצלם", "שימוש כזה מהווה הפרה בוטה של המשפט ההומניטארי הבינלאומי, והוא אסור על-פי פקודות הצבא". בעקבות כך, פנה בצלם לפרקליט הצבאי הראשי בדרישה כי יורה על פתיחת חקירת מצ"ח בעניין.
לפי העדויות שהגיעו לידי הארגון, ב-25.2.07, לפנות בוקר הורו חיילים לעמיד עומיירה, נער בן 15, להתלוות אליהם בסריקות שערכו בשלושה בתים בשכנות למקום מגוריו. באחת הפעמים, לפי עדות זו, ירה אחד החיילים מספר יריות לתוך החדר שנסרק. במקביל, השתמשו חיילים אחרים באופן דומה בבן דודו של הילד, סמאח עומיירה, בן ה-24. אירוע זה תועד בחלקו במצלמות סוכנות הידיעות AP ושודר בהרחבה. בין השאר, אולץ עומיירה להיכנס לכל אחד מחדרי ביתו, כשהחיילים צועדים אחריו. לאחר מכן ירה אחד החיילים צרור יריות לתוך כל חדר.
באירוע אחר, שהתרחש בשעות הבוקר של ה-28.2.07 באותו אזור של שכם, השתלטו חיילים על בית משפחת דעדוש, וחקרו את המשפחה שגרה בו על מקום הימצאם של חמושים פלשתינים שירו עליהם מאזור זה. בערב אילצו החיילים את אחת מבנות המשפחה, ג'יהאן דעדוש בת ה-11, להוביל אותם אל בית סמוך. החיילים אילצו את הילדה לפתוח את דלת הבית ולהיכנס לתוכו לפניהם. לאחר מכן החזירו החיילים את הילדה לביתה. בעדותה ל"בצלם" תיארה הילדה את תחושתה לאחר שהחיילים עזבו אותה: "רעדתי מפחד, חששתי שיהרגו אותי או ישלחו אותי לכלא. הדבר היחיד שרציתי הוא לישון... אני מפחדת שהחיילים יחזרו וייקחו אותי".
מ"בצלם" נמסר אז, כי "מכלול הפרטים העולים מהעדויות, ובפרט הירי לתוך החדרים כפי שתואר בעדויותיהם של עמיד וסאמח עומיירה, מלמדים כי החיילים חששו כי בבתים בהם בוצעו הסריקות מסתתרים חמושים פלשתינים, או הוטמנו מטעני נפץ. המשימות אותן אולצו שני הילדים והמבוגר לבצע בהוראת החיילים היו, אם כן, כרוכות בבירור בסכנת חיים וסביר להניח כי החיילים היו מודעים לכך".