החל מהלילה (יום ו', 21.9.07) בחצות הוטל סגר כללי על שטחי יהודה, שומרון ורצועת עזה. זאת בשל יום הכיפורים שיחול הערב ומחר ועל פי החלטת שר הביטחון, אהוד ברק. הסרת הסגר תיעשה בהתאם להערכת מצב שתתקיים לאחר יום הכיפורים.
במהלך הסגר יורשה מעבר של פלשתינים במעברים במקרים הומניטריים בלבד אשר יאושרו על ידי מנגנוני התיאום והקישור.
מצה"ל נמסר כי כבכל ימות השנה יעשה צה"ל כל שביכולתו על מנת להגן על תושבי מדינת ישראל תוך הימנעות ככל האפשר מפגיעה בחייהם של פלשתינים שאינם מעורבים בטרור.
בתום פעולה בת יומיים וחצי של כוחות צה"ל מן הצנחנים ומגדוד חרוב במחנה הפליטים עין בית אילמא בשכם נעצרו (יום ה', 20.9.07) שלושה מחבלים החברים בחולייה של חמאס. המחבלים העצורים הם ח'אלד נורי, יוסף נאדי ומוסטפה נורי.
בחקירתם הראשונית בשירות הביטחון הכללי הודו השלושה בתכנון פיגועים ובכלל זה התגלה רצונו של מוסטפה נורי לבצע פיגוע התאבדות. עוד עולה מן החקירה כי חברי החוליה השיגו את אמצעי הלחימה לביצוע הפיגועים מראשי ארגון החמאס באזור.
חקירתם של השלושה נמצאת בעיצומה במטרה לחשוף פרטים נוספים אודות פעולתם הצבאית במסגרת החמאס ומעורבותם בתכנון פיגועים נוספים.
הפעולה במחנה הפליטים עין בית אילמא החלה בעקבות מידע מודיעיני מדוייק בדבר חולייה המתכננת לבצע פיגוע. עם זאת יש לציין כי בינתיים לא הוסרה ההתרעה שבגללה פועלים הכוחות בשכם.
