אחרי ארה"ב, שוודיה, קנדה, נפאל, טיוואן, הונגריה, קרואטיה, יפן ודרום אפריקה, תקבל כת הסיינטולוגיה הכרה רשמית גם בפורטוגל. בתקופה הקרובה יוכלו כוהני הסיינטולוגיה בפורטוגל לערוך טקסי נישואין ולוויות, ואולי אף לקבל הטבות כגון פטור מלא ממס ואישור למתן שירותי דת בבתי חולים ובתי הסוהר כפי שבני הדת הקתולית נהנים במדינה.
הנוצרים הפורטוגזים המתנגדים לכת זועמים, ומביעים את כעסם על כך שלמרות שבמדינות כמו צרפת, בלגיה ושווייץ, בהן מוכרת הסיינטולוגיה ככת על-ידי דוחות ממשלתיים, דווקא בפורטוגל תיחשב הכת כארגון דתי.
ארגון הסיינטולוגיה הפורטוגזי נוסד ב-1984, ולאחר מכן כארגון דתי ב-7 באפריל 1988, באישור משרד המשפטים. בהודעה שפרסם ארגון הסיינטולוגיה הפורטוגזי, לאחר החלטת ממשלת פורטוגל, מסרה דוברת הארגון, בטי דמסקו, כי "אנחנו מברכים על ההחלטה, אשר מאפשרת לנו להפיץ את עקרונות הדת שלנו ביתר התלהבות ועוצמה. יש לנו מאות חברי קהילה בליסבון. הם כבר עושים את כל הדרוש כדי להעביר את פעילות הארגון למתקנים גדולים וייצוגיים יותר".
בישראל מציגה הסיינטולוגיה את עצמה כ"ארגון" חילוני, וזאת למרות שבאתר הסיינטולוגיה הרשמי נכתב במפורש כי מדובר על דת, שאף מספקת שירותי דת בהתאם לעקרונות אמונתם. באתר נכתב כי "קהילות של סיינטולוגיה חוגגות חתונות וטקסי הענקת שם על-פי המסכת הטקסית הרשמית שלהן, ומציינות בטקסי הלוויה את פטירתם של חברים. טקסים אלה מועברים לרוב על-ידי הצ'פליין - המנהיג הרוחני. סיינטולוגים מוצאים שטקסי סיינטולוגיה, העוסקים ברוח בהתאם לכתבי הדת, מותאמים באופן ייחודי לצורכיהם ומעניקים איכות מיוחדת לאירועים אלה".