קעקוע עלול להוות סיכון בריאותי חמור אם אינו נעשה בצורה נכונה. יש לבצע את ההליך רק תחת פיקוח מקצועי, היגייני ומוסדר.
ארגון המזון והתרופות האמריקני (FDA) מפרסם רשימת סיכונים אפשריים הקשורים לקעקוע:
- זיהום, כולל דלקת הכבד וזיהומים עוריים.
- בליטות או גושים קטנים שעלולים להווצר סביב האזור המקועקע, הנקראים גרגירומת (סוג גידול).
- במקרים נדירים, עלולה להופיע נפיחות במהלך בדיקות MRI
חוסר יכולת להסיר את הקעקוע.