ראש הממשלה אהוד אולמרט דיווח בישיבת הממשלה (יום א', 28.10.07) כי התנצל בפני ראש ממשלת טורקיה, רצ'פ טאיפ ארדואן, על חדירת מטוסי חיל האוויר למרחב האווירי של טורקיה במהלך התקיפה בסוריה, אם אכן אירוע כזה אכן אירע.
אולמרט מסר לשרים כי אמר לארדואן, כי אם אכן מטוסים ישראלים חדרו למרחב האווירי של טורקיה, הרי שלא הייתה לכך כל כוונה מראש או כל כוונה לפגוע או להביא לערעור כלשהוא של הריבונות הטורקית.
ב-8 בספטמבר דווח כי בתקשורת כי פרשת המטוסים הישראלים שחדרו ביום לסוריה מאיימת להביא לתקרית דיפלומטית בין ירושלים לאיסטנבול. הטורקים טענו כי מצאו בשטחם את מיכלי הדלק של המטוסים הישראלים שחדרו לסוריה, ושר החוץ של טורקיה, עלי בבג'אן דרש מישראל הבהרות, האם חדרו המטוסים גם לתחום האווירי הטורקי. העיתון הטורקי "הורייט" פירסם תצלומים של מיכלי דלק, אשר לטענתו שייכים למטוסי אף-15-איי ישראלים. המיכלים אותרו בשני אתרים שונים הסמוכים לגבול טורקיה-סוריה. המיכלים נמצאו מספר שעות לאחר פרסום הודעת סוריה, לפיה היא מאשימה את ישראל בחדירה למרחב האווירי שלה.
מקור דיפלומטי טורקי דיווח אז כי ארצו ביקשה הבהרות מישראל בנושא. העיתון ציטט מומחי טייס שהעריכו כי המטוסים הישראלים הטילו לקרקע את מיכלי הדלק, על-מנת להוריד ממשקלם ולאפשר להם לטוס מהר יותר בצאתם מהמרחב הסורי.